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通过柔性扫描确定3MC态结构和T1/3MC自由能垒是否正确

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发布时间: 2025-12-26 09:13

正文摘要:

本帖最后由 陈AG 于 2025-12-26 09:27 编辑 各位老师好,我想通过柔性扫描确定金属配合物3MC态(Pt-吡啶断开)的结构,并计算自由能和其与T1的自由能差,具体操作如下: ①首先以T1的结构为初始结构,xtb柔性扫 ...

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wzkchem5 发表于 Post on 2025-12-31 12:05:46
陈AG 发表于 2025-12-30 16:11
感谢老师详细的解答。

①:我尝试了上面您说的反方向扫描,但是得到的曲线是类似的,然后扫描其他坐 ...

有可能这个反应过程涉及多个二面角的协同扭转,那样的话扫哪个二面角都得不到平滑的曲线。如果扫描不是最终目的,最终目的只是得到过渡态,且从扫描曲线的最高点开始优化无法收敛到想要的过渡态的话,建议改用NEB等方法。
wzkchem5 发表于 Post on 2025-12-26 15:19:54
陈AG 发表于 2025-12-26 11:43
王老师,像这种激发态涉及分子内断键的构型转变也需要连续的曲线吗,我的理解是,一个配体的配位键断了, ...

断键的势能曲线一般也没有突变。这里涉及到几点:
(1)锥形交叉点附近的势能面形状,是两侧都以有限的斜率降低。而你扫出来的曲线往右侧的斜率是无穷大。
(2)绝热过程的最小能量反应路径不会经过锥形交叉点,因为从锥形交叉点附近走的能量更低。锥形交叉点好比一个很尖的山顶,要翻过一座山,能量最低的路径肯定是经过一个鞍点(山脊线的最低点),而不是山顶
(3)即使势能面连续,在势能面上的柔性扫描结果仍然可能不连续。参见DOI: 10.1002/wcms.34的图3及相关讨论
陈AG 发表于 Post on 2025-12-26 11:43:38
wzkchem5 发表于 2025-12-26 10:54
当能量出现这种断崖式下跌的时候,一般意味着选取的扫描坐标或者扫描方向不对,此时最高点不是过渡态的好的 ...

王老师,像这种激发态涉及分子内断键的构型转变也需要连续的曲线吗,我的理解是,一个配体的配位键断了,当转到最高点(圆锥交叉点?)之后,就会掉到3MC态的势能面,然后有可能出现这种断崖式下跌,不知道我理解对不对
wzkchem5 发表于 Post on 2025-12-26 10:54:31
当能量出现这种断崖式下跌的时候,一般意味着选取的扫描坐标或者扫描方向不对,此时最高点不是过渡态的好的初猜。建议反过来扫,如果曲线还是不连续,考虑改为扫描其他坐标

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陈AG + 1 谢谢

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