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发现跑出来的IRC呈现这种形式,是不是过渡态有问题?

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发布时间: 2025-12-26 09:37

正文摘要:

寻找过渡态,发现跑出来的IRC呈现这种形式,是不是过渡态有问题?

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2025-12-30 14:56:18
超限制抱怨 发表于 2025-12-29 05:05
sob老师,我也遇到了这类问题。对于能垒极低过渡态的能垒比较,该如何比较能让审稿人信服。在wb97xd/def2 ...

没有叫def2tzvvp的东西
不说具体体系、是什么反应,讨论这个没意义。本来不同理论方法就有不同的适用范畴
sobereva 发表于 Post on 2025-12-30 14:55:06
chansens 发表于 2025-12-29 08:48
进一步计算出的自由能垒

确保单点计算得到的波函数稳定,可以做波函数稳定性测试
并且弄清楚改成大基组后电子能垒是多少,分开来搞清楚情况。电子能垒倘若都不靠谱,说自由能垒没意义
chansens 发表于 Post on 2025-12-29 08:48:48
sobereva 发表于 2025-12-27 02:25
“用shermo计算的吉布斯自由能甚至出现了-100kcal/mol的情况” 完全语义不明,是自由能垒还是什么玩意

进一步计算出的自由能垒
超限制抱怨 发表于 Post on 2025-12-29 05:05:32
本帖最后由 超限制抱怨 于 2025-12-29 05:09 编辑
sobereva 发表于 2025-12-26 11:33
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

sob老师,我也遇到了这类问题。对于能垒极低过渡态的能垒比较,该如何比较能让审稿人信服。在wb97xd/def2tzvvp级别下的势垒与dlpno-ccsd(t)/cc-pvtz下的势垒比较得到完全相反的结果。
另外,在wb97xd/def2tzvvp下为无能垒过程,但在dlpno-ccsd(t)/cc-pvtz级别下为有能垒过程。但其电子能趋势是一致的,考虑吉布斯矫正则出现前述的结果。
sobereva 发表于 Post on 2025-12-27 02:25:50
chansens 发表于 2025-12-26 14:49
好的老师,下次一定注意提问的准确性

我的体系是催化反应,且属于柔性体系。我是用M062X/def2svp做的 ...

“用shermo计算的吉布斯自由能甚至出现了-100kcal/mol的情况” 完全语义不明,是自由能垒还是什么玩意
chansens 发表于 Post on 2025-12-26 14:49:52
sobereva 发表于 2025-12-26 11:33
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

好的老师,下次一定注意提问的准确性

我的体系是催化反应,且属于柔性体系。我是用M062X/def2svp做的几何优化和频率计算,M062X/def2TZVP做的能量计算,后续作能垒图发现,用shermo计算的吉布斯自由能甚至出现了-100kcal/mol的情况,请问sob老师,是哪里出现问题了吗
sobereva 发表于 Post on 2025-12-26 11:33:22
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “过渡态计算” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。

只要整体是单调上升-下降的趋势、曲线平滑,并且IRC能跑到期望的结构就完了,当前毫无必然异常,起码是没给出更多信息的情况下没法说异常。
另外,当前势垒极低,有没有势垒受计算级别影响很大。
Hugo_314cat 发表于 Post on 2025-12-26 10:31:29
看上去只是过渡态和左端的能量差很低而已,无伤大雅。帖子名字建议改具体点。

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