get-it 发表于 2017-5-3 22:19
这种方法怎么样：
A, B两种原子，A-B距离为r。首先随机产生A原子的团簇，检查原子间距，如果小于2r，就认 ...

好的，谢谢哈

这种方法怎么样：
A, B两种原子，A-B距离为r。首先随机产生A原子的团簇，检查原子间距，如果小于2r，就认为两个A原子通过一个B原子相连，在中点（或者偏移一些）放上一个B原子。然后检查B原子之间的距离，如果B-B距离小于某一阈值，可以做两种操作：1， 合并两个B原子，2， 两个B原子朝相反的方向移动。
不过这样还是有一些图中的结构产生不出来，可能还要加些随机的东西。

zyj19831206 发表于 2017-5-3 21:32
ABCLUSTER不知道能不能做这个？张老师编写的那个代码。

棒棒哒，网站上说免费提供代码，并且是C写的。太感谢了。

ABCLUSTER不知道能不能做这个？张老师编写的那个代码。