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通过autoff得出的原子 sigma, epsilon 参数与文献不一样

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发布时间: 2025-12-30 17:47

正文摘要:

本帖最后由 huangzi 于 2025-12-30 18:09 编辑 老师们,我用autoff得出了tfsi-离子的力场,这是获得的原子的 sigma, epsilon 参数 我仔细对比了键角二面角发现两者一致,只有f和o的不符合,想问一下老师我应该 ...

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slxc920113 发表于 Post on 2026-1-1 21:08:23
CL&P或者OPLS2009-IL都是为离子液体专门优化的力场参数,本身就和你文献里面的OPLS-AA不是同一种力场,你不能要求两种不同的力场给出的LJ是一样的吧。
yuechenghua 发表于 Post on 2026-1-1 09:48:17
huangzi 发表于 2025-12-31 23:18
老师,这是我tfsi-离子的结构,f的参数我倾向于使用文献中的,o的目前我不太确定,老师可以给一下建议吗 ...

这个结构N带负电的话多多少少会对S有极化影响,使得LJ势能曲线有一定变形,导致参数有变化。而在oplsaa原力场里没有一模一样的化学环境,最接近这个结构的就是砜类化合物里的S=O(opls_494),但参数和你给的文献不同。所以,如果文献中给出的化合物和你的结构相似你就用文献里的。
这可能的考量是用其他原子种类会缺少对应的二面角参数(比如F-C-S-O),如果你O的原子种类选的很偏,oplsaa中可能没有这个二面角,所以为了避免额外拟合就选了一个有参数的类型去做模拟了。
yuechenghua 发表于 Post on 2025-12-31 09:46:11
oplsaa里面F的种类有好几种,lj参数之间有差异。
opls_786 是PF6-里的F,sigama和epsilon分别是3.11810e-01 、2.55224e-01
opls_965是氟代烷烃里的F,sigama和epsilon分别是2.95000e-01 、2.21752e-01,这个就是你给的文献里的参数。
我不知道你的tfsi-离子是什么结构,你可以自己根据化学环境判断下。
然后O的参数看起来判断成了opls_441,磷酸酯里的双键O,你给出的文献更像opls_278里的C=O双键O,还是一样,找跟你结构环学环境更相似的。
student0618 发表于 Post on 2025-12-30 21:10:52
文献是按什么优化这参数的?

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