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给GaussView添加自定义基团模板

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发布时间: 2026-1-4 14:00

正文摘要:

GaussView自带一些常用的基团模板,主要分为ring fragment,R-group fragment和biological fragment三类,各自有对应的缩略图方便随时取用。但实际操作中还是缺少一些常用的片段,尤其是处理某一个特定的课题时,如 ...

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Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2026-1-4 14:14:29
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2026-1-4 14:17 编辑

在我之前将数据集的金属配合物做成GaussView片段时也发现过扩展GaussView模板的方法、分析过.frg格式的特征,不过没把批量处理的脚本贴出来……

提醒一下mkfrg.py依赖numpy库,mkxbm.py依赖pillow库(PIL),没有的话需要pip install安装。

编辑:除了用mol2指定连接关系外,提供原子坐标再按gview自动成键判定的依据来生成连接关系或许也是个方法。

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