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基于分子力场的能量分解和IGMH分析遇到的问题

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发布时间: 2026-1-4 21:49

正文摘要:

本帖最后由 Jiang152 于 2026-1-5 10:02 编辑 老师们好,模拟的两组片段:第一组片段对应的IGMH和EDA-FF分别为A1,A2;第二组片段对应的IGMH和EDA-FF分别为B1,B2。     关于各个项的正负值有如下两个 ...

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Jiang152 发表于 Post on 2026-1-10 15:38:47
Jiang152 发表于 2026-1-6 09:22
谢谢sob老师的专业指导,我再尝试一下。(ps: 不好意思,IGMH粗心打错成IGNH啦)

原因找到啦,由于没严格按照操作过程进行,实际原子序数跟txt文档中的序数不一致导致。
Jiang152 发表于 Post on 2026-1-6 09:22:31
sobereva 发表于 2026-1-6 00:42
那叫IGMH
1 EDA-FF里静电项为负说明静电作用对结合是有利的,为正说明不利。顺带一提,如果你不打算分解成 ...

谢谢sob老师的专业指导,我再尝试一下。(ps: 不好意思,IGMH粗心打错成IGNH啦)
sobereva 发表于 Post on 2026-1-6 00:42:15
那叫IGMH
1 EDA-FF里静电项为负说明静电作用对结合是有利的,为正说明不利。顺带一提,如果你不打算分解成原子、原子对贡献的话,我更建议用下文的sobEDAw方法,比EDA-FF精度明显更高使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html

2 我怀疑对此结构你的EDA-FF计算方式不对,连总相互作用能都成了正值

仔细检查EDA-FF分析给出的各个原子以及原子对对相互作用能的贡献,总能弄清楚原因
Jiang152 发表于 Post on 2026-1-5 10:03:24
sobereva 发表于 2026-1-5 00:04
绝对不要光给出没什么用的散点图而不给出非常直观的IGMH填色等值面图

实在抱歉,sob老师。我在原来问题上把IGNH等值面图加上了。图B1等值面图中显示蓝色吸引力居多,但是图B2中静电力为正值,我不太理解。(针对这个现象,我再一次计算了第二组片段的EDA-FF,结果还是这样。)
sobereva 发表于 Post on 2026-1-5 00:04:14
绝对不要光给出没什么用的散点图而不给出非常直观的IGMH填色等值面图

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