ayuan 发表于 2026-1-26 19:48 ![]() ,这个是基本的化学常识,你这么做就行了,无需参考资料。你在看看Sob老师的Multiwfn 有电荷分布分析的功能,可以比较一下络合前后氧原子上电荷的转移情况。就看程序的精度够不够。够你就用,不够就不用。 |
BinWang 发表于 2026-1-7 13:04 您好,请问关于这个O原子电子会转移一部分到氢键的O原子上的概念,有没有具体的文献和出处可以参考一下?谢谢 |
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本帖最后由 sgwzq 于 2026-1-8 16:00 编辑 你这个做过构象搜索没?(穷举所有可能的结构,找分子的最低能量的那个值 (注意是最低,而不是几何优化算出来的局部能量极小值)) 如果不太好穷举的话,或许可以先做个静电势图看看阴离子哪里最负,把最负的位置摆过去做个优化或者扫描看看。 如果电子能量更低,那说明现在的结构更稳定。 如果有好几个构象能量都很低,可以用玻尔兹曼分布算下大概的比例。 另外氢键有饱和性,这个位阻看起来也不小,我觉得可能不是O--H--O的结构。 我自己在算的时候,发现N/O/F形成的氢键也大多是2-3A的距离。正常的氢键不是这个数值吗? |
BinWang 发表于 2026-1-7 13:04 好的,谢谢,我去尝试一下 |
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本帖最后由 BinWang 于 2026-1-7 13:09 编辑 氢键中的H原子吸引一个氧原子,另一个O原子电子会转移一部分到氢键的O原子上。所以一个H同时连接两个以上的O是困难的。建议用wb97xd泛函,更精确一些。http://sobereva.com/272,体系很小基组可以更大一些。 |
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