sobereva 发表于 2026-2-2 03:40 好的，谢谢社长！！ |
moiraaa 发表于 2026-2-1 16:41 某种福井函数越正的地方，暗示（但不一定真的准确）相应类型反应在此处发生的可能性越大。 也要注意局限性（不限于福井函数），参考量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班（http://www.keinsci.com/WFN）这页幻灯片我的总结： 
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sobereva 发表于 2026-2-1 00:39 谢谢社长的解答 1蓝色是正的，红色是负的 2绿色是正，蓝色是负 |
moiraaa 发表于 2026-1-31 17:19 1、2 每次提问都要描述完整、严谨，先说清楚绿色和蓝色是什么含义，哪个是正那个是负 3 你载入的是哪个态的fch文件，Multiwfn产生的电子密度cub文件就对应哪个态的电子密度 4、5 都用N态的电子密度格点数据定义电子密度的等值面 |
本帖最后由 moiraaa 于 2026-1-31 17:43 编辑 sobereva 发表于 2026-1-31 05:17 社长，想请教您几个问题： 1.是不是f+,f-,f0的填色等值面都要看蓝色越深的地方,反应活性越大？ 2.在vmd中看f+,f-,f0是不是就是看绿色的部分，反应活性越大？ 3.画f+的等值面图时，按照博文402的操作得到的第一个density.cub是不是N+1.cub？ 4.画f+的填色等值面图时，是把N+1.cub拖到gview里，载入f+吗？ 5.画f0的填色等值面，是不是把N.cub拖到gview里，载入f0吗 |
sobereva 发表于 2026-1-31 05:17 好的，社长，真的是一语道破梦中人，感谢社长 |
moiraaa 发表于 2026-1-30 21:01 N.fch和N+1.fch里的原子序号根本不一样，进入Multiwfn主功能0一看便知 先确保所有波函数文件里相同序号的原子的坐标都一样再说，否则结果都是错的 |
sobereva 发表于 2026-1-29 16:17 好的，谢谢社长，我先去做等值面图 |
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你先看Multiwfn直接显示的f+的等值面图，像下文那样，这最清楚直观。把f+等值面图的特征和简缩福井函数对上了，再去试图对照f+等值面图和分子表面f+填色图。 使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量 http://sobereva.com/484（http://bbs.keinsci.com/thread-13328-1-1.html） 当前你的格点数据看起来可能有问题。先确保能完整重复下文的福井函数填色图例子，避免细节弄错了 基于Multiwfn产生的cube文件在VMD和GaussView中绘制填色等值面图的方法 http://sobereva.com/402（http://bbs.keinsci.com/thread-7756-1-1.html） 我现在不方便检查你的文件 |
moiraaa 发表于 2026-1-28 19:44 色彩刻度要体现颜色变化方式 图片放到文章里必须给出color bar “拼这张图”语义不明 都已经说了不建议用f+ 简缩福井函数总能和分子表面福井函数填色图（恰当选取电子密度等值面数值和色彩刻度范围的情况下）对应上。另外，福井函数等值面图比填色图更常用 |
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表格里那叫简缩福井函数不叫福井函数，认真看下文 计算化学中的一些常见不良写法和用词 http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html） 亲电取代反应中活性位点预测方法的比较（http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract28694.shtml） Comparative study on the methods for predicting the reactive site of nucleophilic reaction（https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11426-015-5494-7） gview里显示的是分子表面的f+的填色等值面图，不能叫等值面图，这和f+的等值面图完全是两码事。 若不给出色彩刻度，填色图则毫无意义。 另外，f+预测亲核反应位点本来就比较烂，准确度差，仔细看 Comparative study on the methods for predicting the reactive site of nucleophilic reaction（https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11426-015-5494-7） TCA上的一篇对比不同原子电荷预测反应位点、亲电/亲核性的文章（http://bbs.keinsci.com/thread-15512-1-1.html） 还不如用Multiwfn算Hirshfeld电荷、LEAE（下文）、双描述符等讨论 使用Multiwfn通过局部电子附着能(LEAE)考察亲核反应位点、难易及弱相互作用 http://sobereva.com/676（http://bbs.keinsci.com/thread-38416-1-1.html） |
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