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求助，关于电解液的拓扑文件构建流程是怎样的

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L228870573

发布时间: 2026-2-19 11:00

正文摘要:

目前我想做一个H2O、Zn(BF)4、sulfolane、ZnCl2电解液的分子动力学，有几个问题不明白。 1、Zn2+应该用什么力场，拓扑文件该怎样产生？ 2、BF4-是采用Sobtop例1中的做法产生拓扑文件，还是用参考文献中提及的OPLS ...

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L228870573 发表于 Post on 4 hour ago

student0618 发表于 2026-2-19 14:47
1. 直接引用力场自带的ions.itp或者用Merz

2-4. OPLS和GAFF不兼容，只能选其一。

十分感谢耐心解答

，我参考了Sobtop的例1和以及《使用Sobtop超级方便地创建二茂铁的GROMACS的拓扑文件》，使用Gaussian对BF4做优化+振动分析，关键词#p tpssh/def2tzvp opt freq，优化后的out文件用Gaussian view查看了键角为90°，现有文献记载是109.5°，键长也不一致，这种情况是我优化的过程写错了关键词吗？

student0618 发表于 Post on 前天 14:47

本帖最后由 student0618 于 2026-2-20 01:40 编辑

1. 直接引用力场自带的ions.itp或者用Merz

2-4. OPLS和GAFF不兼容，只能选其一。
如果用GAFF/GAFF2直接用Multiwfn及Sobtop算，简单直接。
如果用文献OPLS-AA要补没有的参数就LigParGen跑再用Multiwfn算电荷，见计算适用于OPLS-AA力场做模拟的1.2*CM5原子电荷的懒人脚本 http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 21462&fromuid=64740 (出处: 计算化学公社)

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