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lammps计算md后统计rdf中配位数提问

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GHR1111

发布时间: 2026-2-25 10:55

正文摘要:

图1和图2的体系都是1M NaPF6 in DME的体系，但是从图中溶剂的配位数分析，1个是3左右，1个是6左右，想问问具体什么含义

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sobereva 发表于 Post on 2026-2-26 16:30:06

GHR1111 发表于 2026-2-26 10:07
嗯嗯好的老师，这两个图大概都是0.3nm左右为第一溶剂化壳层，这个位置做垂线，第一个图DME的CN大概为6左 ...

也许是，拿不准就发邮件问作者

GHR1111 发表于 Post on 2026-2-26 10:07:25

sobereva 发表于 2026-2-26 05:54
你只需要关注配位距离内（如rdf峰后面第一个极小点或者第一次收敛到0的位置，结合实际情况确认意义）的配位 ...

嗯嗯好的老师，这两个图大概都是0.3nm左右为第一溶剂化壳层，这个位置做垂线，第一个图DME的CN大概为6左右，对应6个O参与溶剂化配位，第二个图dme的cn大概对应3左右，只有3个O参与溶剂化配位。但是这两篇文章给出的溶剂化结构都是三个dme螯合配位Na离子。我个人初步猜测的是，cn为3的是不是把1个dme的两个O统计为1个。想请问老师这种想法对不对

sobereva 发表于 Post on 2026-2-26 05:54:35

你只需要关注配位距离内（如rdf峰后面第一个极小点或者第一次收敛到0的位置，结合实际情况确认意义）的配位数曲线最后的值，甭管最后收敛到多少

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