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用动力学的方式（如xtb在GFN2-xTB下跑）产生traj.xyz并结合molclus做构型搜索就完了，这是对当前体系我最推荐的方式，参考下文。动力学过程中自然会自发调整离子与溶剂的结合方式 使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html |
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