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用vmd画ESP图,无法调色

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发布时间: 2026-3-1 18:13

正文摘要:

在Linux系统里的Multiwfn,我按照http://sobereva.com/612里面的步骤输入数字(如图) ,纯白色,没有什么明显的区别。不用脚本的方法是因为自己的电脑算不动这个体系,只能借助服务器去算。

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微塑料 发表于 Post on 2026-3-4 19:36:43
sobereva 发表于 2026-3-1 20:56
自己参照txt文件里的命令把电子密度和静电势的cub文件在服务器上算好、恰当命名后放到VMD目录下,直接用下 ...

感谢,改名后,正常了
睡觉不打鼾 发表于 Post on 2026-3-3 10:41:55
本帖最后由 睡觉不打鼾 于 2026-3-3 10:46 编辑

纯手动教程:


估计是最后一步没调对数值范围,范围过大导致所有等值面都在色块中间,所以是白色

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sobereva 发表于 Post on 2026-3-1 20:56:36
自己参照txt文件里的命令把电子密度和静电势的cub文件在服务器上算好、恰当命名后放到VMD目录下,直接用下文的ESPiso命令绘制。VMD不熟的人不要自己折腾VMD
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html

SharkYYX2025 发表于 Post on 2026-3-1 19:45:04
本帖最后由 SharkYYX2025 于 2026-3-1 20:05 编辑

你是把cub直接拖进去了吗,这个载入方法和原贴说的好像不是一个意思,ESP用vmd显示也有脚本的。可以把cub文件压缩用网盘传上来看看,或者截图vmd里rep窗口的样子

使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示  http://sobereva.com/443
注意看最后一段


可以随便找个小分子在自己电脑算一下ESP(有现成的fch文件),然后拿vmd画图试试。判断一下是新算的cub有问题还是载入有问题,或者装的vmd有问题

李唯一 发表于 Post on 2026-3-1 19:25:50
本帖最后由 李唯一 于 2026-3-1 19:26 编辑

你把算完的文件传到你自己的电脑上不就能用脚本了吗,我都是计算用服务器,处理数据用自己的笔记本电脑

singes 发表于 Post on 2026-3-1 18:44:07
可能是VMD的颜色范围没对应好你的计算值范围,你的计算结果范围都在它默认值的中间值附近,所以不红不蓝。

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