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求助：基于键临界点的电子密度估计内氢键键能

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yangna11

发布时间: 2026-3-4 14:24

正文摘要:

各位老师好，我用AIM拓扑分析基于键临界点的电子密度估计内氢键键能，图片如下，发现化合物A的苯环的碳原子和化合物B的苯环的碳原子之间连接的也有键径，是否说明两个苯环的碳原子之间也存在氢键相互作用。请各位老 ...

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yangna11 发表于 Post on 2026-3-5 11:09:46

sobereva 发表于 2026-3-5 09:04
你当前关心的是氢键，你不管其它BCP和拓扑路径不就完了
pi-pi作用区域为什么不能出现键径？什么时候键径 ...

好的，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2026-3-5 09:04:56

yangna11 发表于 2026-3-5 08:56
谢谢老师。这个图是通过Multiwfn结合VMD自动绘制的AIM拓扑分析图，因此我要手动把这几个不是氢键的键径删 ...

你当前关心的是氢键，你不管其它BCP和拓扑路径不就完了
pi-pi作用区域为什么不能出现键径？什么时候键径必须对应氢键了？
强烈建议系统学习AIM拓扑分析知识：
量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班（http://www.keinsci.com/WFN）
AIM学习资料和重要文献合集 http://bbs.keinsci.com/thread-362-1-1.html

yangna11 发表于 Post on 2026-3-5 08:56:50

wal 发表于 2026-3-4 14:53
推荐了解一下键临界点(BCP)是什么，这不是一个氢键的专属概念，C-C氢键是个很幽默的说法
可以说这里存在相 ...

好的，谢谢老师。

yangna11 发表于 Post on 2026-3-5 08:56:22

sobereva 发表于 2026-3-5 08:32
做分析时要结合最基本常识，都不涉及氢怎么可能是氢键
认真把此文看了
谈谈pi-pi相互作用

谢谢老师。这个图是通过Multiwfn结合VMD自动绘制的AIM拓扑分析图，因此我要手动把这几个不是氢键的键径删除吗。这个地方应该是pi-pi相互作用，但是不知道为什么这个地方会有键径

sobereva 发表于 Post on 2026-3-5 08:32:47

做分析时要结合最基本常识，都不涉及氢怎么可能是氢键
认真把此文看了
谈谈pi-pi相互作用
http://sobereva.com/737（http://bbs.keinsci.com/thread-51636-1-1.html）

wal 发表于 Post on 2026-3-4 14:53:46

本帖最后由 wal 于 2026-3-4 14:57 编辑

推荐了解一下键临界点(BCP)是什么，这不是一个氢键的专属概念，C-C氢键是个很幽默的说法
可以说这里存在相互作用，看着像pi-pi stacking，做个NCI/IGMH应该可以看到绿片片

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