使用Haddock进行核酸蛋白对接时无法进行三分子对接该怎么解决？

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发布时间: 2026-3-12 17:40

本帖最后由 qiyachen 于 2026-3-12 17:38 编辑大家好，我是一名在读研究生，目前正在尝试使用Haddock对连接酶和双链DNA分子进行对接，以模拟连接酶连接DNA末端。但是因为初次接触分子对接，还在摸索阶段，很多相 ...

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qiyachen 发表于 Post on 2026-3-18 09:38:12

student0618 发表于 2026-3-15 21:12
https://alphafoldserver.com/welcome

好的，非常感谢！我再尝试一下

student0618 发表于 Post on 2026-3-15 21:12:49

qiyachen 发表于 2026-3-15 15:01
谢谢你！但是我用Alphafold，分别输入DNA序列还有蛋白质序列提交以后，对接得到的结果很奇怪。两分子对接 ...

qiyachen 发表于 Post on 2026-3-15 15:01:10

student0618 发表于 2026-3-12 17:47
Alphafold 3

谢谢你！但是我用Alphafold，分别输入DNA序列还有蛋白质序列提交以后，对接得到的结果很奇怪。两分子对接里面，蛋白和DNA离得很远，三分子对接里面，虽然蛋白和DNA对接在一起了，但是两条DNA链是重叠在一起的。请问你知道这种情况怎么解决吗？

student0618 发表于 Post on 2026-3-12 17:47:31

Alphafold 3

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