Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2026-3-18 23:37 老师,关于您昨天说的方法,我已经找到了方法进行输出,但是却提示我LIBVORI没有成功安装,可否请老师移步我的新帖子指点一下。 |
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2026-3-18 23:37 好的 谢谢老师 |
KaZikl 发表于 2026-3-18 22:18 最简单的办法就是把&GLOBAL/PROJECT_NAME定的全局任务名字改成别的,因为&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY/FILENAME的默认输出文件名就是这个名字加-pos-1.xyz后缀。如果不想再输出一次和REFTRAJ一致的轨迹文件,可以把&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY设为OFF有意关闭。 如果CP2K是用toolchain配的依赖,那应该默认安装了libvori的,跑任务的输出文件"CP2K| cp2kflags"这一行链接库名称里有libvori和libbqb可以确认。 |
本帖最后由 KaZikl 于 2026-3-18 22:25 编辑 Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2026-3-18 20:23 老师,感谢您的回复,我也很奇怪的就是 按照Computing Bulk Phase Vibrational Spectra*with CP2k and TRAVIS (2018)这个教程给出的CP2K运行代码就可以运行,但是改为自己的文件名就不行,我检查了一下,和教程就差了一个&GLOBLE中的FFTW_PLAN_TYPE EXHAUSTIVE;以及文件的名字,请问这个如果要设置自己的文件名,要在&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY/FILENAME中再给出一个新的轨迹名称吗? 关于您提到的直接转为BQB格式,感谢老师的指点!我想请问一下,为了跑这个我已经在云计算安装了CP2K2026.01,如果再添加libvori 需要重新进行编译吗? |
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看来还得加个特殊的终止逻辑与警告信息,触发于设置了&MOTION/&MD/&REFTRAJ/TRAJ_FILE_NAME读已有轨迹文件、没有显式设置&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY/FILENAME输出新轨迹文件、且前者与后者默认设置重名的情况。 顺便提醒一句,这样重跑轨迹得到2000个电子密度的cube文件非常吃硬盘空间和读写速度,在CP2K工具链装有libvori时可以考虑换用E_DENSITY_BQB关键词直接输出bqb格式的TRAVIS的输入文件,不一定要先输出cube再压缩。 |
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