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amIGM方法分析烟酰胺晶体（C6H6N2O）分子间存在的弱相互作用有关散点图绘制的问题

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轻舟~

发布时间: 2026-3-26 10:43

正文摘要:

我想使用amIGM方法分析一下烟酰胺晶体分子间存在的弱相互作用，之所以使用amIGM方法是想学习一下，而不是真正的分析烟酰胺晶体分子间存在的弱相互作用。我先用CP2K对含有4个分子共60个原子的烟酰胺晶体进行分子动力 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2026-3-27 05:45:22

不要24小时内在思想家公社QQ群和计算化学公社论坛里问同一问题，注意看群规（http://sobereva.com/QQrule.html），以及论坛置顶的论坛新社员必读贴。你在1号群已经问过了

群里的我的回复：
如果是分子晶体，应当用mIGM而不是amIGM
对于mIGM，绘制散点图用的是Multiwfn自带的IGMscatter.gnu
并且检查Multiwfn导出的output.txt文件内容确保没问题

轻舟~ 发表于 Post on 2026-3-26 22:32:32

还是不行。。

轻舟~ 发表于 Post on 2026-3-26 16:20:05

好吧，我再试试重新生成一下

pal 发表于 Post on 2026-3-26 15:35:23

那个warning应该是说你的output.txt文件里绝大部分数据都是0，这个文件应该是有问题的

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