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求助需要冻结原子的molclus报错:Cannot find .xtboptok file!

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发布时间: 2026-3-28 19:08

正文摘要:

本帖最后由 啥也不会 于 2026-3-28 19:09 编辑 各位老师好!       我正在进行手性修饰基的单层COF环与R/S布洛芬的结合能的计算,因为体系比较大所以用molclus+xTB的方法进行构象搜索。 &n ...

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啥也不会 发表于 Post on 2026-4-2 12:26:20
sobereva 发表于 2026-4-1 01:55
molclus没有自动删*.inp的步骤
尝试改个名或者放到其它目录再试,--input后面也可以用相对路径或绝对路 ...

好的好的,感谢老师回复,已经用设绝对路径解决了
sobereva 发表于 Post on 2026-4-1 01:55:54
啥也不会 发表于 2026-3-29 11:07
感谢老师回复,用linux确实解决了这个问题,但是我还想用constrain来限制原子位置,请问molclus有什么方 ...

molclus没有自动删*.inp的步骤
尝试改个名或者放到其它目录再试,--input后面也可以用相对路径或绝对路径
啥也不会 发表于 Post on 2026-3-29 11:07:54
sobereva 发表于 2026-3-29 06:20
如果是自己手动用molclus产生的xtb输入文件时xtb运行也中途突然停止,xtb若用的windows版改用linux版;若li ...

感谢老师回复,用linux确实解决了这个问题,但是我还想用constrain来限制原子位置,请问molclus有什么方法可以实现吗,我发现单纯改setting,ini里的 xtb_arg为 "--gfn 2 --chrg -1 --uhf 0 --input xtbopt.inp --parallel 4" 并且把这个.inp放到相应文件夹,molclus开始运行时会把这个.inp删掉
sobereva 发表于 Post on 2026-3-29 06:20:31
如果是自己手动用molclus产生的xtb输入文件时xtb运行也中途突然停止,xtb若用的windows版改用linux版;若linux版也这样,尝试其它版本、其它计算级别(如GFN-FF)、其它溶剂模型、不同并行方式等再试

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