求助：NVT平衡看RMSD时看单个分子还是包含相同分子的较多分子

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发布时间: 2026-4-2 11:45

求助：我想要构建一个油水体系（上层为水相，下层为油相，油相采用四组分：饱和烃，芳香烃，胶质(C21H26，58个分子)和沥青质（C43H46N2O6，2个分子），中间加入表面活性剂SDS），能量最小化之后我模拟了80ns的NVT平 ...

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student0618 发表于 Post on 2026-4-2 12:39:50

这体系看的可能需要是rmsd以外的，参考下文第三节

谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 2&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)

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