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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › gromacs GPU加速和CUDA版本有关么？

gromacs GPU加速和CUDA版本有关么？

查看数: 149 | 评论数: 1 | 收藏 Add to favorites 0

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发布时间: 2026-4-6 22:53

正文摘要:

如题，我在跑一个蛋白-配体体系，之前实验室的服务器有RTX3090，但是一直用的都是CPU跑，没有安装GPU加速版本GROMACS，我昨天重新编译了一下，速度提升非常显著。十几万原子的体系，步长设置为0.01，跑100ns，原本可 ...

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sobereva 发表于 Post on 6 day ago

性能关键是GROMACS的版本以及GPU利用率，驱动能兼容就行了

步长设置为0.01指代不明，如果是ps，全原子模拟不可能10fs步长

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