Graphite 发表于 2018-3-5 05:15 按照推荐，我在仔细研究用户手册并实际尝试后，想就此纠正一下，截至1.7.1版本（2022年），cclib依旧不支持对柔性扫描结果的解析输出。 另外需要注意的是，强行采用cclib处理柔性扫描结果，并不会报错，但是会输出错误的数值。比如对49个点的柔性扫描解析，scanenergies命令同样会输出49个数值，但是这49个数值与真实各点能量毫无关系，反而会产生误导效果！ |
lijiayisjtu 发表于 2018-3-3 13:53 你做的是放松的势能面扫描（“软扫”），前面楼层提到的都是（固定其他几何参数的）势能面扫描（“硬扫”）。硬扫是势能面扫描n个点，软扫本质上是用脚本生成了n个opt任务。 ---- 根据你的关键字，会得到键长vs能量的关系。gview似乎可以直接查看（很久没用了，抱歉）。 如果手动操作，那么只要两列数据，第一列是键长从初始值开始每次改变-0.1，第二列是每次的能量，然后用任何绘图软件处理即可。 另，cclib（https://cclib.github.io/index.html）可以自动化解析输出文件，无需额外操作。 |
Graphite 发表于 2018-3-3 11:25 我的任务类型也是scan #p opt=modredundant 6-31+g(d) um062x,scan的是键长B 3 7 S 20 -0.100000，但早log文件中也并没有找到几何参数1-几何参数2-能量的关系，可能是我意思没表达清楚，麻烦了 |
lijiayisjtu 发表于 2018-3-2 13:47 1.我没有强调过关键词是什么，你at错人了 2.这个帖子关注的是几何参数1-几何参数2-能量的关系，任务类型是SCAN |
Graphite 发表于 2017-8-5 12:06 您好，为什么我打开log文件后，定位的是结果是Summary of Optimized Potential Surface Scan 而非summary of the potential surface scan? |
Graphite 发表于 2017-9-14 21:18 好的，谢谢 |
本帖最后由 Graphite 于 2017-9-14 21:20 编辑 xujian 发表于 2017-9-14 19:31 我这是2017版,公社里有下载.选曲面图,下拉出现3D颜色映射曲面 
|
|
请问在哪个工具栏啊？ |
xujian 发表于 2017-9-14 16:39 是的 |
Graphite 发表于 2017-8-5 12:06 请问，您这个映射图是用origin做的吗？ |
youyno 发表于 2017-5-17 19:45 请问您有sigmaplot安装包吗，我上回下载的试用到期了，就不能用了，不知您是否可以提供一个sigmaplot的安装包 |
Graphite 发表于 2017-8-5 12:06 谢谢Graphite。 学会了。 |
|
本帖最后由 Graphite 于 2017-8-5 12:07 编辑 1.将SCAN的结果从.log文件复制出来
2.导入到origin等绘图程序中（如必要先把上面的多行数据保存成txt，再用绘图软件导入之）
3.绘制-颜色映射的曲面图
|
| 参与人数Participants 2 | eV +7 | 收起 理由Reason |
|---|---|---|
|
| + 6 | 又用一次。 |
|
| + 1 |
本帖最后由 meatball1982 于 2017-8-4 17:21 编辑 youyno 发表于 2017-5-17 19:45 youyno 你好。 在扫一个变量时，你说的是可行的。 如果是扫两个变量。右键就没有保存数据的选项了。 请问你的gauss view是什么版本的，我的是5.08 更新： 别一个可能的解决方法，可以直接通过log文件提取。 “Summary of the potential surface scan:“ |
sd_save.png (58.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 64)
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2026-2-27 23:03 , Processed in 0.178178 second(s), 26 queries , Gzip On.
组图打开中，请稍候......
收藏 Add to favorites
