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CP2K能否做电子打入水溶液的AIMD模拟

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发布时间: 2026-4-9 11:12

正文摘要:

本帖最后由 northern_mar 于 2026-4-11 09:46 编辑 各位老师好,近期看到一篇做电子束辐照催化的文章,因为他们组的文章可以说是电子束催化领域的标杆,所以想学习一下。 他们用AIMD过程描述反应过程,但是个人 ...

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northern_mar 发表于 Post on 14 hour ago
sobereva 发表于 2026-4-11 11:21
这种结合过程本来就能用AIMD跑出来
北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)里 ...

谢谢卢老师,我回去再重新看看讲义
sobereva 发表于 Post on 前天 11:21
northern_mar 发表于 2026-4-11 09:38
好的,谢谢您!
也感觉蛮奇怪的,因为论文中认为的机理是水合电子跟氢离子结合成氢自由基,然后再活化N2 ...

这种结合过程本来就能用AIMD跑出来
北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)里给了水合电子的AIMD模拟例子,倘若体系里有水合质子,当MD过程中二者碰上的时候就会出现氢自由基
sobereva 发表于 Post on 前天 11:20
northern_mar 发表于 2026-4-11 09:48
谢谢卢老师,还想请教一下AIMD是否可以做过渡态的搜索?因为文章中没有专门写搜索过渡态的过程,所以比较 ...

完全是两码事
搜索过渡态属于静态计算范畴
northern_mar 发表于 Post on 前天 09:48
sobereva 发表于 2026-4-9 11:45
我没时间具体看这文献,光从你贴出来的部分,并没有说具体怎么做。原理上CP2K没法设置让单独一个电子怎么运 ...

谢谢卢老师,还想请教一下AIMD是否可以做过渡态的搜索?因为文章中没有专门写搜索过渡态的过程,所以比较疑惑。(如帖子图4)
northern_mar 发表于 Post on 前天 09:38
highlight 发表于 2026-4-10 14:44
看上去就是水合电子AIMD。如果你也是水溶液,不如试试 PBEh40-rVV10,在水合电子与小分子溶液体系里效果应 ...

好的,谢谢您!
也感觉蛮奇怪的,因为论文中认为的机理是水合电子跟氢离子结合成氢自由基,然后再活化N2。也感觉蛮神奇的,AIMD居然能跑出来这么复杂的反应过程。
northern_mar 发表于 Post on 前天 09:31
ultramanm87 发表于 2026-4-10 13:39
看描述就是charge -1然后用PBE0跑AIMD。这个截断够吗?rel_cutoff呢?

不太清楚 SI中关于理论计算的描述就只有这些了
ljh123 发表于 Post on 3 day ago
这竟然算的动吗,非常有钱的感觉
highlight 发表于 Post on 3 day ago
看上去就是水合电子AIMD。如果你也是水溶液,不如试试 PBEh40-rVV10,在水合电子与小分子溶液体系里效果应该是目前最好的。
当然,这个泛函为了保证水的 gap 足够大把 HF 调的很高,结果就是校正后的水合电子VDE很准,但是溶质的应该会明显高估。

原文献:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpclett.7b00699
塞个私货:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.0c01123

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ultramanm87 发表于 Post on 3 day ago
本帖最后由 ultramanm87 于 2026-4-10 13:42 编辑

看描述就是charge -1然后用PBE0跑AIMD。这个截断够吗?rel_cutoff呢?
sobereva 发表于 Post on 4 day ago
我没时间具体看这文献,光从你贴出来的部分,并没有说具体怎么做。原理上CP2K没法设置让单独一个电子怎么运动,但可以描述水合电子

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