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QM/MM研究酶催化反应机理，频率计算时水分子上很多虚频

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发布时间: 2026-4-14 19:02

正文摘要:

在用ORCA QM/MM研究酶催化反应机理，由于加水后体系很难收敛，所以我起初只考虑了两个靠近底物的水分子，并将它们与底物7 Å范围内的氨基酸残基一起放入MM活性区，几何优化正常结束后进行数值频率计算，发现所有 ...

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Huschein 发表于 Post on 3 hour ago

我没搞明白首先你QMMM了还能扩到800原子体系呢？那为什么不只做QM cluster呢？其次加入水不加水都没什么错但是QMMM算振动分析的意义是什么呢？你的TS又不是真正TS搜索算法算出来的你的freq算出来水是大虚频也理所应当

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