MD時蛋白中的配體不定期大幅度震盪位移問題

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发布时间: 2017-5-18 16:58

本帖最后由 HarrisLin 于 2017-5-18 19:37 编辑上一次請教完RMSD分析後這篇目前正在做MD後的RMSD分析先說明狀況 1.ProteinBackbone_MOL(ligand) RMSD分析從圖2可以看出我的配體會不定期從蛋白中 ...

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sobereva 发表于 Post on 2017-5-18 20:16:15

正常现象
你可以用trjconv带着-pbc nojump参数处理一下轨迹得到不启用PBC的轨迹，从而避免突跃

参与人数 Participants 1	eV +1	收起理由 Reason
HarrisLin	+ 1	謝謝Sob老師之後就去測試

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