关于伞形采样计算PMF，在最后PMF没有向0收敛的情况

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发布时间: 2026-5-10 21:44

各位老师好，我最近模拟了一个PFOA分子穿过不同孔径的树脂孔道的过程，我的几个树脂孔道都是差不多4nm长，使用pull命令得到了分子移动10nm的轨迹，从轨迹中每隔0.1nm选取一个窗口，看PFOA从进孔前到出孔的情况，使用 ...

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海棠依旧cdut 发表于 Post on yesterday 22:13

我感觉你应该先检查你的histogram有没有合适的重叠。我之前做的时候遇到PMF曲线不对的时候大多数情况就是histogram没有合适重叠。这个时候就要考虑牵引力设置的问题了

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