体系共3w原子左右,跑了gromacs100nsmd模拟,取了最后的10n用李继存老师的脚本计算了结合能,发现这个值一会正一会负,这是怎么回事。问过ai,周期边界效应,拼接都做过了,还是这样. 小分子rmsd高的原因推测是它是 ...
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