求助pdb2gmx生成蛋白质拓扑文件时的错误

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发布时间: 2026-5-19 11:42

我的蛋白质保留了部分与蛋白质具有相互作用的水分子，之后用pdb2gmx生成蛋白质拓扑文件时选择的是amber19sb，水模型是OPC，结果出现报错。主要问题是Residue 'HOH' not found in residue topology database，将pdb文 ...

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Amyluck 发表于 Post on 6 hour ago

好的，谢谢老师，我这就去查看

sobereva 发表于 Post on yesterday 22:19

自行看相应力场目录下的rtp文件，里面的水是什么名字，结构文件里的残基名就改成什么

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