请问如何模拟三聚氰胺甲醛树脂表面吸附分子过程？

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Lym

发布时间: 2026-5-19 22:13

当前我想要模拟溶剂环境中A分子吸附在三聚氰胺甲醛树脂上(由三聚氰胺甲醛聚合物:MF resins作为微球壳；尺寸大约在微米级别). 由于实验获得的三聚氰胺甲醛树脂微球太大，且还希望能够使用Gromacs进行计算，所以想到 ...

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student0618 发表于 Post on yesterday 10:11

注意amber19sb是蛋白力场。水模型是例如opc/opc3/spce/tip3p，Amber系列小分子的话是GAFF/GAFF2。

Slab模型很常用的，可放心去用。

1 和 2 用周期性跑的话都是差不多的，分子都会跨pbc跑另一头。只想考虑其中一个表面的2可以加wall。

akakcolin 发表于 Post on yesterday 09:50

这个简化思路很合理，方案1合适；方案2可能需要对聚合物底层的位置进行强约束
热固性树脂，默认交联，低聚物不太合适，不过高分子量也不好模拟。
其实你的问题核心是需要构建一个无定形交联的模型

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