老师，为什么做NVT总是报LINCS WARNING？

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发布时间: 2026-5-30 00:15

老师，我的结构用ORCA做过几何优化了，也做好了非标准氨基酸残基力场文件，做NVT总是出现这种情况：我查了一下有问题的原子是MET以及其中一个非标准氨基酸残基。我想请教老师，这是我的结构有问题吗，还是力场文 ...

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KazusaT 发表于 Post on 3 hour ago

感觉是不太对，有两行
CA H N -C
CA O C -N
这个CA上连接了6个原子明显不对吧

sobereva 发表于 Post on 3 hour ago

参考http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8

如果真空中模拟单个分子都有问题，几乎一定是拓扑文件的问题

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