409407227 发表于 2020-10-15 21:52
这是什么软件啊，求教，VMD吗？感觉分子结构好漂亮

就是VMD，改一下材质就是这种效果。算不上多漂亮，诸如SAMSON、ChimeraX默认效果比这个更好看

这是什么软件啊，求教，VMD吗？感觉分子结构好漂亮

laifeng20151107 发表于 2017-5-26 15:50
谢谢！我可能没有表述清楚。 我的英文的主句是：H-O bond 变长了。氢氧键中的氧与铜成键是作为定语修饰H- ...

acetate ion结构里的两个 C-O几乎是均等化了，所以都有一定的双键成份（可以从共振角度来看）。所以在acetate ion结构中，你就说C-O键而不提具体的单双键是可以的。你那句句子没问题，能够清晰表达你所要表达的意思，不过最好在句子中直接指明（C1-O2）或者（C1-O1）会更加直观清晰。另外，其实图1中的C1-O2相对于C1-O1还是更有双键成份的（键长明显短）。你把C1-O2 说成C=O也没问题。

冰释之川 发表于 2017-5-26 13:06
The O atoms beside the carbonyl groups are bonded with the Cu atom.

谢谢！我可能没有表述清楚。 我的英文的主句是：H-O bond 变长了。氢氧键中的氧与铜成键是作为定语修饰H-O键，用来区别另一个H-O 键。我自己的写的句子是The C-O bonds that contain the oxygen atoms bonded to the copper ion are stretched, while the other C-O bonds are shortened when compared with that in acetate ion. 我建模的时候是用的双键，但我觉得对几何优化后的结构提单双键不合吧，O atoms beside the carbonyl groups或者是 CO single bond。我把acetate ion的优化结构也放上去了。这个就不分不出单键双键。

The O atoms beside the carbonyl groups are bonded with the Cu atom.

xujian 发表于 2017-5-26 10:34
就写CO single bond不行吗

刚刚搞错了，现在在看看

就写CO single bond不行吗