GROMACS做能量最小化的问题

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发布时间: 2017-6-13 16:33

老师们好，最近用gromacs跑动力学发现，在最小化的时候，有某些步数里面没有数据，但仍能正常结束得到em.log和em.gro。请问这会影响接下来的退火和MD吗？（多次跑动力学发现有时候md能继续进行，有时候不能。）请问 ...

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sobereva 发表于 Post on 2017-6-13 21:28:23

只要EM之后的结构合理，MD能正常跑起来，就没事
即便MD跑不起来也和这个没直接关系

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