antechamber程序中的APS.dat文件

查看数: 8959 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 1

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2017-6-30 14:27

不知道哪位老师，有研究过amber中antechamber中dat文件夹中的内容，最近在拟合Se原子的力场参数时，因为没有Se 原子，在生成gro,top.时，遇到报错信息：The frozen atom type can only be 1, 2, 3, 7 (aromatic sing ...

回复 Reply

guoy14iccas 发表于 Post on 2017-7-3 09:47:51

ggdh 发表于 2017-7-2 15:39
Se和S很像，找个S的复制过来就行了。不过S的价态多。找相应价态的复制过来，比如2价的S AV2那里就是0

非常感谢

ggdh 发表于 Post on 2017-7-2 15:39:45

本帖最后由 ggdh 于 2017-7-2 15:42 编辑

guoy14iccas 发表于 2017-7-1 10:42
非常感谢您，请问您有改过这个文件的经验吗？感谢指点。

Se和S很像，找个S的复制过来就行了。不过S的价态多。找相应价态的复制过来，比如2价的S AV2那里就是0

参与人数 Participants 1	eV +1	收起理由 Reason
sobereva	+ 1

guoy14iccas 发表于 Post on 2017-7-1 10:42:06

ggdh 发表于 2017-6-30 22:30
Atomic Penalty Scores (aps) For Different Atom Types In Bond Type Perception., AV0-AV6 Stand For Ato ...

非常感谢您，请问您有改过这个文件的经验吗？感谢指点。

ggdh 发表于 Post on 2017-6-30 22:30:49

Atomic Penalty Scores (aps) For Different Atom Types In Bond Type Perception., AV0-AV6 Stand For Atomic Valence 0 to 6.

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register