MD RMSD分析是否合理

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发布时间: 2017-7-3 23:15

本帖最后由 HarrisLin 于 2017-7-4 01:30 编辑因為實驗室今年才剛開始用GROMACS 實驗室也沒有經驗豐富的博班前輩可以請教老闆又是那種要靠學生update最新資訊的教授所以只好又上來請教了希望前輩幫我看看這 ...

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kunkun 发表于 Post on 2017-7-7 22:17:14

动力学有混沌效应，就算直接MD也都会不一样，当然重新来一套也花不了多少时间..（膜平衡另论）

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sobereva 发表于 Post on 2017-7-4 01:39:03

当前不是挺好的么
你也可以统计一下所有原子，而不仅仅是backbone原子，由于侧链容易波动，所以RMSD比只统计backbone往往会更大

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