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自由能计算对优化与单点级别的敏感性测试

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发布时间: 2017-8-27 21:29

正文摘要:

本帖最后由 liyuanhe211 于 2020-4-17 04:25 编辑 之前在群里讨论通常所做 低级别优化 + 高级别单点 的合理性问题,一时不知如何解释,遂当时提交了一系列计算验证此事。这期间 Sobereva 老师已发布讨论相同问题 ...

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lanthanum 发表于 Post on 2023-7-12 20:44:21
前两个图可以正常显示,后面5个表格显示不出来。能否将表格直接上传到帖子里,而不是使用外链?谢谢李老师。
dnlx 发表于 Post on 2022-3-20 01:20:52
感谢楼主分享;关于“对涉氢的反应,优化可以不给氢加极化”,有的反应是这样的,比如C6H5 + C2H6 --> C6H6 + C2H5,但也有反例,比如CH3S + CH4 --> CH3SH + CH3。这个反应如果优化的时候氢不加极化,与氢加极化相比,自由能垒低估了2 kcal/mol以上,而且初级DKIE也大大低估了。不知道是不是因为后一个反应的过渡态虚频比较小(过渡态平缓),自由能对结构比较敏感。所以保险起见,对涉氢的反应优化的时候氢确实也要加极化。
美泽虎 发表于 Post on 2021-8-9 21:16:55

那我下次要试试对比一下def-TZVP和def2-TZVP了
喵星大佬 发表于 Post on 2021-8-8 14:13:45
美泽虎 发表于 2021-8-8 12:28
谢谢楼主!有一点不明白第四个表格,M06-2x-D3泛函下,为什么def-TZVP会比def2-TZVP的结果还会好一些

撞大运
美泽虎 发表于 Post on 2021-8-8 12:28:13
谢谢楼主!有一点不明白第四个表格,M06-2x-D3泛函下,为什么def-TZVP会比def2-TZVP的结果还会好一些
你猜啊啊啊 发表于 Post on 2020-4-17 12:05:13
liyuanhe211 发表于 Post on 2020-4-17 04:28:18
本帖最后由 liyuanhe211 于 2020-4-17 11:13 编辑
你猜啊啊啊 发表于 2020-4-17 01:19
老师,好几个图又没有了
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你猜啊啊啊 发表于 Post on 2020-4-17 01:19:39
老师,好几个图又没有了
liyuanhe211 发表于 Post on 2020-3-5 00:59:30
pika02 发表于 2020-3-4 23:39
图又挂了,浏览器一直在显示连接old.chem.pku.edu.cn,是图源的服务器挂了还是换地址了?

修复了。彻底转移到其他image host的网站上了。
原先在鄙组自己的网站上,然而化院课题组网站前后换了三次网址(其中一次是因为四月六十五日,后来又换回去了,后来出毛病了又换了一次),有毛病。
pika02 发表于 Post on 2020-3-4 23:39:59

图又挂了,浏览器一直在显示连接old.chem.pku.edu.cn,是图源的服务器挂了还是换地址了?
liyuanhe211 发表于 Post on 2018-3-16 10:18:18
asdf 发表于 2018-3-16 09:22
这个帖子图片怎么没有了?

已修复
asdf 发表于 Post on 2018-3-16 09:22:50
这个帖子图片怎么没有了?
liyuanhe211 发表于 Post on 2017-8-30 08:33:01
本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-9-4 16:43 编辑
smutao 发表于 2017-8-30 08:18
一个很大的问题在于:
只测试了一个体系
和娃娃的帖子同样的问题

确实有这个问题
smutao 发表于 Post on 2017-8-30 08:18:22
一个很大的问题在于:
只测试了一个体系
和娃娃的帖子同样的问题
liyuanhe211 发表于 Post on 2017-8-29 18:14:57
ggdh 发表于 2017-8-29 17:10
不行啊,因为参考值还是固定的。
比如说PBE0-D3/def-TZVP 的单点下,HF3C几何优化的表现竟然比DSD-PBE ...

做好了。这样确实清晰很多,谢谢!

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