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ICSS研究芳香性的问题

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发布时间: 2017-8-30 14:58

正文摘要:

老师,请问我在绘制ICSS的过程中,生成的.gif会在文件夹中吗?这里生成了但是文件夹里没有,也不能生成.out文件,希望得到老师的解答。

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2017-8-30 21:13:58
落花飘雨679 发表于 2017-8-30 21:08
谢谢老师,我明白了,老师如果是比较大的体系,十几个苯环,格点间距一般设为多大比较好?


跟你的计算能力、计算级别都有关系。计算总耗时和格点数成正比,视情况而定。点数越多图像越平滑但也越耗时。
落花飘雨679 发表于 Post on 2017-8-30 21:11:43
liyuanhe211 发表于 2017-8-30 20:25
如果有队列系统的话用队列系统,如果没有,把这些gjf文件放到一个文件夹里,写一个sh文件,比如run.sh, ...

谢谢老师的解答,明白了
落花飘雨679 发表于 Post on 2017-8-30 21:08:04
sobereva 发表于 2017-8-30 20:42
用这里提到的脚本批量执行
使用Gaussian时的几个实用脚本和命令
http://sobereva.com/258

谢谢老师,我明白了,老师如果是比较大的体系,十几个苯环,格点间距一般设为多大比较好?
sobereva 发表于 Post on 2017-8-30 20:42:48
落花飘雨679 发表于 2017-8-30 20:16
老师,生成的.gif文件找到了,但应该怎样调用高斯运行?谢谢老师

用这里提到的脚本批量执行
使用Gaussian时的几个实用脚本和命令
http://sobereva.com/258
liyuanhe211 发表于 Post on 2017-8-30 20:25:06
本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-8-30 20:26 编辑

如果有队列系统的话用队列系统,如果没有,把这些gjf文件放到一个文件夹里,写一个sh文件,比如run.sh,里面每行是一条正常的命令,如
  1. g09 NICS0001.gjf NICS0001.out
  2. g09 NICS0002.gjf NICS0002.out
  3. 。。。
  4. g09 NICS0017.gjf NICS0017.out
复制代码
可以用excel的公式辅助写这些命令。然后cd到gjf文件所在的目录下,运行". run.sh"(不含引号)就可以了
落花飘雨679 发表于 Post on 2017-8-30 20:23:33
liyuanhe211 发表于 2017-8-30 20:18
跑高斯用什么系统

老师用的是Linux
liyuanhe211 发表于 Post on 2017-8-30 20:18:36
落花飘雨679 发表于 2017-8-30 20:16
老师,生成的.gif文件找到了,但应该怎样调用高斯运行?谢谢老师

跑高斯用什么系统
落花飘雨679 发表于 Post on 2017-8-30 20:16:25
liyuanhe211 发表于 2017-8-30 16:20
把手册首页“!!!!!!!!!! ALL USERS MUST READ !!!!!!!!!!”看了,此即说明不理解当前目录在哪儿

老师,生成的.gif文件找到了,但应该怎样调用高斯运行?谢谢老师
liyuanhe211 发表于 Post on 2017-8-30 16:20:45
把手册首页“!!!!!!!!!! ALL USERS MUST READ !!!!!!!!!!”看了,此即说明不理解当前目录在哪儿

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