关于计算非键相互作用的疑问

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发布时间: 2017-9-4 21:46

我的疑问有两个： (1) 有donor和acceptors但是没有氢键生成，是否因为体系中氢原子较少。 (2)当分析energy的时候，由于是中性体系，是否就不用计算静电作用能，将LJ-SR和LJ-1-4相加就是非键相互作用能。谢 ...

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wx91aaa 发表于 Post on 2017-9-5 09:13:11

sobereva 发表于 2017-9-4 23:04
hbond命令在统计时O-H和N-H被作为氢键给体，O和N被作为氢键受体，其它的情况不被考虑

“通过DFT计算分子 ...

谢谢sob老师。是分子表面静电势，谢谢老师指正。

sobereva 发表于 Post on 2017-9-4 23:04:15

hbond命令在统计时O-H和N-H被作为氢键给体，O和N被作为氢键受体，其它的情况不被考虑

“通过DFT计算分子表面电荷”这话不确切，要么是原子电荷，要么是分子表面静电势

中性体系间通常照样有静电相互作用能，毕竟算相互作用是基于原子电荷的，而不是基于分子整体净电荷来算的。

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