谢谢sobereva老师! 2#的MW Cartesian velocity 这一部分应该就是初始的每个原子的质量加权笛卡尔速度, 单位是amu^1/2 *Bohr/秒,呵呵 |
0.5292就是波尔和埃的转换因子。很明显你的图中键长的变化就是因为单位转换问题。输出数据中没看到比例关系大抵是高斯自动调整了朝向。 |
MW就是质权。 凡是量化程序里没写单位的情况,一般都是a.u.。所以坐标也是,看看和你输入的坐标是不是相差0.5292倍数。 Scaled就是给所有随机生成的速度统一乘上一个倍数,目的大抵是让实际速度和所设的核动能相对应。 我没仔细看过ADMP的原理,但核动能显然是主导体系运动的关键,所以只默认设了NKE,电子密度的动能应该是随着模拟的进行自发地调整的。 |
再补充一点 Summary information for step 0 Time (fs) 0.000000 EKinC = 0.1000000; EKinPA = 0.0000000; EKinPB = 0.0000000 EKin = 0.1000000; EPot = 0.0424303; ETot = 0.1424303 ETot-EKinP = 0.1424303 Integrand for the Velocity-Velocity Auto-Correlation Function = 1.875165884684D-01 Angular momentum JX = 0.5354349475D-13 JY = -0.6119176536D-13 JZ = -0.7359657037D-14 Jtot = 0.8164252893D-13 H-BAR; J (Quantum Number) = 0.0000000000D+00 Total energy 1.424302843D-01 A.U. Total angular momentum 8.164253D-14 h-bar Tr(PA)-NA = -4.441D-15 Tr(PA**2-PA) = -6.217D-15 Tr[(PA**2-PA)**2] = 2.116D-16 Tr(PB)-NB = 3.553D-15 Tr(PB**2-PB) = 3.553D-15 Tr[(PB**2-PB)**2] = 1.989D-16 Cartesian coordinates: ----------跟初始坐标差别挺大的,原因是什么? I= 1 X= 0.000000000000D+00 Y= 0.000000000000D+00 Z= 5.742058886893D+00 I= 2 X= 0.000000000000D+00 Y= 0.000000000000D+00 Z= 3.693509644025D+00 I= 3 X= -1.931390739074D+00 Y= 0.000000000000D+00 Z= 6.424908628216D+00 I= 4 X= 9.656953695372D-01 Y= 1.672633449877D+00 Z= 6.424908628216D+00 I= 5 X= 9.656953695372D-01 Y= -1.672633449877D+00 Z= 6.424908628216D+00 I= 6 X= 0.000000000000D+00 Y= 0.000000000000D+00 Z= -5.755121020403D+00 MW Cartesian velocity--------------------感觉这个才是是原子初始的质量加权笛卡尔速度?不确定,单位是? I= 1 X= -5.221249413169D+13 Y= -5.677815764071D+13 Z= -2.066213619163D+13 I= 2 X= 1.394847384944D+14 Y= 4.426775937225D+13 Z= 1.367062020509D+13 I= 3 X= -1.743830650957D+13 Y= 1.805533178926D+14 Z= 1.225194878119D+14 I= 4 X= -7.180746158116D+13 Y= 2.812417586915D+13 Z= 1.406033014533D+14 I= 5 X= 1.596075614346D+14 Y= -6.784011882900D+13 Z= 2.116633187409D+14 I= 6 X= -7.450327864891D+12 Y= 2.714770778965D+12 Z= -1.047137323671D+14 |
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