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如何进行ESR顺磁谱图的模拟?

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发布时间: 2017-10-17 14:49

正文摘要:

找了一些这方面的文献,但是基本没有详细说明用的什么软件或者是什么基组什么的,有没有哪位大神做过这方面的模拟,提供一下资源或方法,不胜感激?

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wangzhe 发表于 Post on 2023-7-6 17:27:22

感谢
wzkchem5 发表于 Post on 2023-7-6 17:19:52
wangzhe 发表于 2023-7-6 09:49
BP86和BP计算的D和E张量结果是一样的。不知道这两个是否是同一个泛函。

是一个泛函
wangzhe 发表于 Post on 2023-7-6 16:49:21

BP86和BP计算的D和E张量结果是一样的。不知道这两个是否是同一个泛函。

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QuantumicGuy 发表于 Post on 2023-7-6 16:23:40
wangzhe 发表于 2023-5-19 16:17
之前用ORCA计算的时候用BP/EPR-II计算的结果和实验值最为吻合,不过应该是case by case,仅供参考。

是BP86吗?
QuantumicGuy 发表于 Post on 2023-6-13 10:24:20
考虑的原子数太多Matlab也会崩掉,我的建议是先把自旋密度图画出来,然后根据自旋密度分布大的位置,去选择计算那些磁性核。总的来说条件就是:磁性核、该磁性核周围自旋密度大
wangzhe 发表于 Post on 2023-5-19 16:17:19
之前用ORCA计算的时候用BP/EPR-II计算的结果和实验值最为吻合,不过应该是case by case,仅供参考。
wzkchem5 发表于 Post on 2023-5-19 16:17:14
自由风 发表于 2023-5-19 08:35
我算的A值大的有130,小的有15,最小的只有个位数。那手动删除的话15左右的算小吗?大小是指的绝对值吗?

结合你所用的lwpp,判断这个较小的A值有或者没有会不会显著影响峰形。最简单的方法是,另模拟一个只有一个A值的信号,其A值等于比如说15,lwpp和你当前模拟相同。然后看看去掉这个A值会不会显著影响峰形
自由风 发表于 Post on 2023-5-19 15:35:19
wzkchem5 发表于 2023-5-18 18:31
手动删掉那些很小的、你不用计算就知道不会对谱图有显著影响的A值,再算。easyspin计算慢一般都是因为考 ...

我算的A值大的有130,小的有15,最小的只有个位数。那手动删除的话15左右的算小吗?大小是指的绝对值吗?
wzkchem5 发表于 Post on 2023-5-18 18:31:08
自由风 发表于 2023-5-18 08:47
是很慢,慢到我以为是软件卡死了。你有解决方法吗?

手动删掉那些很小的、你不用计算就知道不会对谱图有显著影响的A值,再算。easyspin计算慢一般都是因为考虑了太多核的A值,实际上很多核的A值很小或者可以用展宽(lwpp)等效代替,没必要在计算中显式考虑。
自由风 发表于 Post on 2023-5-18 15:47:29
nnzhang 发表于 2018-5-10 11:21
在用matlab结合easyspin进行谱图模拟的时候,原子数大于20个后就计算很慢很慢,这个是什么原因呢?有没有 ...

是很慢,慢到我以为是软件卡死了。你有解决方法吗?
wzkchem5 发表于 Post on 2021-1-4 17:25:49
fond 发表于 2021-1-4 11:26
通过实验电子自旋共振可以定性测出实验中产生自由基的类别,比如有DMPO-OH,DMPO-SO4.-。想问一下可以模 ...

可以,但没必要。这种自由基,尤其是DMPO-OH肯定有文献的实验谱图,跟实验比是更加靠谱的,没必要做计算。如果捕捉了一个比较奇怪的自由基,比如什么金属自由基、簇合物自由基之类的,那还值得算一下。
fond 发表于 Post on 2021-1-4 11:26:29
dana19851128 发表于 2018-4-1 17:42
我是做电子顺磁计算的 有什么问题?

通过实验电子自旋共振可以定性测出实验中产生自由基的类别,比如有DMPO-OH,DMPO-SO4.-。想问一下可以模拟计算DMPO-OH,DMPO-SO4.-的EPR谱图吗?这样的话实验和计算可以吻合,同时证明一下,确实是羟基自由基和硫酸根自由基。可以计算吗?如果可以的话,请问是怎么做呢?
mengtian1234 发表于 Post on 2020-7-1 17:57:04
dana19851128 发表于 2018-4-1 17:42
我是做电子顺磁计算的 有什么问题?

请问我要怎么做电子顺磁计算,今天刚装了一个ORCA,我要使用什么基组和关键词
nnzhang 发表于 Post on 2018-5-10 11:21:15
dana19851128 发表于 2018-4-1 17:42
我是做电子顺磁计算的 有什么问题?

在用matlab结合easyspin进行谱图模拟的时候,原子数大于20个后就计算很慢很慢,这个是什么原因呢?有没有什么解决办法呢?

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