1 根据化学知识和实际情况判断带多少电荷。笛卡尔坐标和电荷无关。
2 用ultraedit的列编辑模式很简单就能插入一列1。如果只写坐标不写0或1，也默认是优化所有原子。
3 Multiwfn不支持mopac产生的波函数。Multiwfn可以在promolecular近似下做RDG分析，只需要提供原子坐标就够了，此帖有说明
使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
http://sobereva.com/68

sobereva 发表于 2015-1-28 12:50
明显没有可执行权限，MOPAC2012.exe权限是rw-rw-r，没x。
应当用chmod +x MOPAC2012.exe给它增加可执行权 ...

Sob，请教一个问题：
你以前的贴在“大体系弱相互作用解决之道”，牵涉大MOPAC2012的使用，下面的例子：
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
PM7 CHARGE=-10 MOZYME
molecule
All coordinates are Cartesian
O       4.71271832 0   9.26971072 0  -7.55066164 0
C       4.13662696 0   9.48826045 0  -8.82968461 0
C       2.75025629 0   8.84701245 0  -8.99475234 0
...（剩余的坐标）
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
请问：
1）这里面, CHARGE=-10，如何知道一个体系带的电荷呢？比如用Gview输出一个笛卡尔坐标，哪一行是体系电荷？
2）如果优化结构，是不是要加Opt关键词？（要挨个写1？几百个原子）
3）生成什么样的文件，能用你的波函数分析软件打开？进行reduced density gradient分析（弱力的等作用面）？谢谢。

按照Chmod -x不报权限的错误了，不过还要经过实践检验，再请教，谢谢

license已经安装上了，再次请教一下：mopac2012多核并行是默认的吗？谢谢！能否给我一个你做过的链接，让我看看如何做输入文件？谢谢

明显没有可执行权限，MOPAC2012.exe权限是rw-rw-r，没x。
应当用chmod +x MOPAC2012.exe给它增加可执行权限

sobereva 发表于 2015-1-28 11:58
你用ls -l查看一下，到底是否是777了。

会了 帮我看看什么问题，谢谢。是否linux不认exe文件？

你用ls -l查看一下，到底是否是777了。

sobereva 发表于 2015-1-28 11:11
密码可以用这个：1591535a16518252

按照您提供的先前的方法安装了，但到了MOPAC2012 [license]这一步运行的时候，总出现  /home/mopac/MOPAC2012.exe: permission denied报错，mopac已经给了chmod 777的权限了。不知道哪些除了问题？

按照您提供的先前的方法安装了，但到了MOPAC2012 [license]这一步运行的时候，总出现  /home/mopac/MOPAC2012.exe: permission denied报错，mopac已经给了chmod 777的权限了。不知道哪些除了问题？

谢谢 刚才翻看到你的先前的帖子，我安装了一下，还没有安装上。再试试！谢谢

密码可以用这个：1591535a16518252