酶与底物结合能能量分解所遇到的问题

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发布时间: 2017-10-29 00:39

请教大家一个问题利用Amber中MMPBSA.py进行了能量分解分解的delta值如图所示该酶的催化残基为10ASP和120ASP，但计算结果居然为正值，文献说正值不利于底物结合。。感觉这个计算结果难以解释。。请教下这 ...

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qiaobeiming 发表于 Post on 2017-10-29 20:29:13

这个要学习

sobereva 发表于 Post on 2017-10-29 14:42:14

根据MMPBSA分解出的具体的项，与实际MD跑出来的结构进行对照，包括考虑位阻、原子电荷等特征，看能否对各个物理项能有个合理的解释

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