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gmx energy计算库伦作用的问题

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发布时间: 2017-11-9 11:16

正文摘要:

         请问 43  coul-SR A-A ,这里面的A是带正电的组分,为什么计算出来的数值会是负值?还有当A只有一个带正电分子的时候为什么也会有数值,而且数值为负数?还请各 ...

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1427437701 发表于 Post on 2017-11-9 15:31:03
sobereva 发表于 2017-11-9 15:27
如果A组就是这个MEY,那我也不清楚,理应不应该有负值

好的,谢谢老师!
sobereva 发表于 Post on 2017-11-9 15:27:03
1427437701 发表于 2017-11-9 15:03
我这个分子好像所有的原子都带正电,计算的coul-SR是 -340,请问老师,这是哪里出错了?

如果A组就是这个MEY,那我也不清楚,理应不应该有负值
sobereva 发表于 Post on 2017-11-9 13:51:43
我不清楚你的体系的具体构成,A是一个还是多个分子、怎么分布的,负值不是不可能出现的。
只有一个带正电分子时,分子内部正负电荷相互作用,可以令分子内部静电作用为负(只要分子内有带负电荷的原子,就有这种可能,比如就两个原子,一个是+2.0,一个是-1.0,整体带+1.0)

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