snljty2 发表于 2022-10-6 19:17
把/2删了。

好的，感谢

静静子 发表于 2022-10-6 14:32
set begx [expr $cenx-$fragdx/2]
set begy [expr $ceny-$fragdy/2]
set begz [expr $cenz-$fragdz/2]

把/2删了。

set begx [expr $cenx-$fragdx/2]
set begy [expr $ceny-$fragdy/2]
set begz [expr $cenz-$fragdz/2]
set endx [expr $cenx+$fragdx/2]
set endy [expr $ceny+$fragdy/2]
set endz [expr $cenz+$fragdz/2]
将$fragdz改为比如2*$fragdz，就可以让箭头长度变为之前两倍。是加减号后面的$fragdz都改为2*$fragdz，才表示键长变为两倍嘛？

set begx [expr $cenx-$fragdx/2]
set begy [expr $ceny-$fragdy/2]
set begz [expr $cenz-$fragdz/2]
set endx [expr $cenx+$fragdx/2]
set endy [expr $ceny+$fragdy/2]
set endz [expr $cenz+$fragdz/2]
将$fragdz改为比如2*$fragdz，就可以让箭头长度变为之前两倍。是加减号后面的$fragdz都改为2*$fragdz，才表示键长变为两倍嘛？

静静子 发表于 2022-7-21 12:14
老师您好，按照您的帖子流程，
18   //电子激发分析功能
1    //空穴-电子分析

VMD启动后文本窗口输入pwd，显示的目录在哪，tcl脚本就放到哪

老师您好，按照您的帖子流程，
18   //电子激发分析功能
1    //空穴-电子分析
Azobenzene.out   //Gaussian输出文件
1    //选第一激发态
5    //将跃迁偶极矩进行分解
1    //跃迁电偶极矩
当前目录下得到了trdipcontri.txt，将trdipcontri.txt拷到VMD目录下，并将帖子中的loaddip.tcl文件拷入VMD文件夹下，启动VMD，将pdb文件导入，然后在VMD的文本窗口运行source loaddip.tcl命令执行，结果显示couldn't execute "C:\Users\wenjing\Desktop\loaddip.tcl": no such file or directory，可能是我自己的操作问题，但不知是哪里出了问题，麻烦sob老师了

sobereva 发表于 2022-2-11 01:23
-用 to 替换，逗号用空格替换

谢谢社长解答！

桌坛新星10500 发表于 2022-2-10 21:11
"然后在VMD文本窗口中依次输入
dip "serial 1 to 11"
dip "serial 12 13"

-用 to 替换，逗号用空格替换

"然后在VMD文本窗口中依次输入
dip "serial 1 to 11"
dip "serial 12 13"
dip "serial 14 to 24"
这里诸如serial 1 to 11代表选择1到11号原子."
sob老师您好，请教老师在这一步中，如果我要考虑的某个片段原子序号不是连续的例如：“2,5,7,12-16,19-22,27-59”为一个取代基片段的原子序号，这种情况该如何在vmd中输入呢？

Sway 发表于 2021-6-22 21:25
sob:老师怎样把电/磁偶极矩矢量在同一个图中表现出来?

分清楚磁偶极矩和跃迁磁偶极矩

要在图中表现什么矢量，就用VMD中的绘图命令相应地画箭头就完了

sob:老师怎样把电/磁偶极矩矢量在同一个图中表现出来?

今日在官网更新的Multiwfn已经支持对两个激发态之间计算原子/片段对其跃迁电偶极矩的贡献

好的，谢谢！！！

Realzlzl 发表于 2017-12-13 09:22
sob老师，您好，某种分子的极化率是常数嘛？与电场或者波长有一定的函数关系吗？谢谢！

极化率分静态和含频极化率，后者和外场频率有关，前者是0频极限的值。