计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

IRC只能向一边跑,如何解决?

查看数: 26444 | 评论数: 21 | 收藏 Add to favorites 2
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2017-12-12 10:42

正文摘要:

对过渡态进行IRC验证,结果IRC只能跑一半,无论加reverse还是forward都不行?请问该如何解决?

回复 Reply

小西瓜123 发表于 Post on 2022-1-22 11:02:46
xujian 发表于 2017-12-12 15:20
服务器好牛逼,用CCSD走IRC

你好,请问您用ccsd做IRC的输入文件怎么写的呢?我先做了半数值的freq, 然后读取chk,readfc,还是没算就报错了,您可以分享一下您的输入文件吗?我的输入文件如下
%chk=r3-ts-irc-test
%nprocshared=8
%mem=16gb
# ccsd(maxcycle=500)/aug-cc-pvtz freq

freq

0 1
O                  0.05120100    1.24334900    0.00000000
H                  0.06339300    0.07509000    0.00000000
O                  0.05120100   -1.08448300    0.00000000
H                 -0.88260300   -1.34602500    0.00000000

--Link1--
%chk=r3-ts-irc-test
# CCSD/aug-cc-pVtZ Geom=Check Guess=Read IRC=(Maxpoints=40,readFC,lqa)

irc

0 1
sun20201028 发表于 Post on 2020-11-30 09:27:36
一直在路上 发表于 2017-12-14 08:13
sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。

楼主,请问这个问题解决了吗?
sobereva 发表于 Post on 2019-4-28 04:25:19
自制奶酪 发表于 2019-4-27 14:39
你好。我对过渡态做IRC验证的时候也是只跑出一半,请问你怎么解决的呢,能告诉我一下吗

这里说得极为清楚
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html
自制奶酪 发表于 Post on 2019-4-27 14:39:40
一直在路上 发表于 2017-12-14 08:13
sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。

你好。我对过渡态做IRC验证的时候也是只跑出一半,请问你怎么解决的呢,能告诉我一下吗
sobereva 发表于 Post on 2018-4-9 02:34:54
lijiayisjtu 发表于 2018-4-8 14:23
应该不是计算方法和基组的问题,想问下您,这问题后来是怎么解决的,IRC 只跑了一半

在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400
lijiayisjtu 发表于 Post on 2018-4-8 14:23:34
一直在路上 发表于 2017-12-14 08:13
sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。

应该不是计算方法和基组的问题,想问下您,这问题后来是怎么解决的,IRC 只跑了一半
一直在路上 发表于 Post on 2017-12-14 19:49:54
sobereva 发表于 2017-12-14 16:35
步长比默认增大一倍看看
其实用双杂化怎么也够了,此时用calcfc、recalc都方便

我用CCSD跑的irc,加calcfc的话没有解析二阶倒数。目前我用的是rcfc
sobereva 发表于 Post on 2017-12-14 16:35:08
一直在路上 发表于 2017-12-14 08:13
sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。


步长比默认增大一倍看看
其实用双杂化怎么也够了,此时用calcfc、recalc都方便
一直在路上 发表于 Post on 2017-12-14 08:13:59
sobereva 发表于 2017-12-12 20:02
优化过渡态时用tight收敛限,之后走IRC再试
步长不可能增加到200,绝对死掉。适当增大步长有可能解决当前 ...

sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。
一直在路上 发表于 Post on 2017-12-13 20:38:10
lip 发表于 2017-12-13 15:54
这一个问题Sob老师之前也解释过,可以在站内搜索一下。

看你的问题应该是过渡态位置不正确,找到的不是s ...

过渡态振动模式正确,通过其他方法基组已经优化出TS并且进行了IRC的验证,现在换成CCSD方法重新进行计算,TS也优化出来,且振动模式正确,但就是IRC前半部分跑不出来
lip 发表于 Post on 2017-12-13 15:54:24
这一个问题Sob老师之前也解释过,可以在站内搜索一下。

看你的问题应该是过渡态位置不正确,找到的不是s=0的位置,而是在“坡”上。
先检查过渡态振动模式是否正确,在看虚频大小是否合适
sobereva 发表于 Post on 2017-12-12 21:50:00
xylz6188 发表于 2017-12-12 21:26
谢谢sobereva老师!我试一试。另外前次在群里请教你计算偶极矩的方法,你推荐用b3lyp/Def2-QZVPD。我用这 ...

我推荐的是def2-TZVPD。没必要QZ
算反应机理用def2-TZVP就已经足够了,不要加D,也不要用QZ,否则白费时间。
你当前的问题不是基组的事
xylz6188 发表于 Post on 2017-12-12 21:26:45

谢谢sobereva老师!我试一试。另外前次在群里请教你计算偶极矩的方法,你推荐用b3lyp/Def2-QZVPD。我用这个方法和基组来做反应机理,优化反应复合物,最后变成产物了,过渡态有很多虚频,这是怎么回事sobereva老师,再次请教一下!
一直在路上 发表于 Post on 2017-12-12 21:23:40
sobereva 发表于 2017-12-12 20:02
优化过渡态时用tight收敛限,之后走IRC再试
步长不可能增加到200,绝对死掉。适当增大步长有可能解决当前 ...

谢谢sob老师!
过渡态我用tight重新计算一下,再跑IRC看看结果。
步长增加到200果断死掉

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 09:16 , Processed in 0.196840 second(s), 31 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list