三石草祭 发表于 2017-12-12 21:10 是 |
sobereva 发表于 2017-12-12 19:41 sob老师，我想咨询下关于二聚体光谱的计算问题，对于单个分子可以用高斯优化并得到它对应的吸收和发射光谱，对于二聚体该怎么处理呢，放在一起优化后的对应的光谱？这里面应该是考虑了分子间相互作用后的结果吧 |
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氢键是必然有的。 不确定怎么摆合适就用genmer自动生成各种可能的二聚体初始构型、批量优化，来找最稳定的二聚体构型，仔细阅读 genmer：生成团簇初始构型的超便捷工具 http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2369 使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索 http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=577 找到最稳定构型后，用Multiwfn分析，就更具体了解弱相互作用特点了 Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览 http://sobereva.com/252 |
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