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绘制有填色效果的用于弱相互作用分析的RDG散点图的方法

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sobereva

发布时间: 2017-12-17 20:41

正文摘要:

绘制有填色效果的用于弱相互作用分析的RDG散点图的方法Method to draw RDG scatter map with coloring effect for weak interaction analysis 文/Sobereva @北京科音First release: 2017-Dec-17 Last ...

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jingetiema6112 发表于 Post on 2024-7-23 15:37:50

sobereva 发表于 2024-7-23 03:36
1 拿不准就一律带着色散校正，下文明确说了
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”
http://sobere ...

好的，感谢卢老师指导

sobereva 发表于 Post on 2024-7-23 03:36:16

jingetiema6112 发表于 2024-7-19 20:46
卢老师您好，请教您2个问题，（1）用DFT-B3LYP/6-311G**优化邻硝基苯胺的结构，并且基于这个优化结构算了一 ...

1 拿不准就一律带着色散校正，下文明确说了
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”
http://sobereva.com/413

2 严格来说是

jingetiema6112 发表于 Post on 2024-7-19 20:46:52

卢老师您好，请教您2个问题，（1）用DFT-B3LYP/6-311G**优化邻硝基苯胺的结构，并且基于这个优化结构算了一系列性质。但是当研究邻硝基苯胺中分子内氢键这种弱相互作用时，看您的博文说应该考虑色散。像这种情况还能不能用DFT-B3LYP/6-311G**优化的这个结构啊？还是必须考虑色散，比如在B3LYP-D3(BJ)/6-311G**水平上重新优化，再基于这个重新优化的结构研究弱相互作用？
（2）仍然是用DFT-B3LYP/6-311G**优化邻硝基苯胺的结构，但是预测某些性质时，用到的公式是基于DFT-B3PW91/6-31G*得到的经验公式。像这种情况是不是也需要把邻硝基苯胺在DFT-B3PW91/6-31G*下重新优化，然后再用这个公式进行计算？

sobereva 发表于 Post on 2022-7-23 14:33:51

好运来发表于 2022-7-23 11:34
老师您好，我完全跟着您的方法用gnuplot生成的.ps文件，ghostscipt和irfanview装好之后里面自带的例子可 ...

没具体信息没法说
至少得提供你的output.txt，能让别人重复你的情况

好运来 发表于 Post on 2022-7-23 11:34:14

sobereva 发表于 2022-6-30 00:48
ghostscript没恰当安装，或者没被irfanview识别，或者你的ps文件本身就有毛病

老师您好，我完全跟着您的方法用gnuplot生成的.ps文件，ghostscipt和irfanview装好之后里面自带的例子可以打开，但我自己生成的ps文件就打不开，我也觉得是文件的问题，该怎么解决呢

好运来 发表于 Post on 2022-7-23 09:55:45

Manyu 发表于 2022-6-29 11:38
请问为何我下载了ghostscript，还是无法用irfanview打开RDGmap.ps

您好，我也出现了这个问题，请问您解决了吗

sobereva 发表于 Post on 2022-7-18 11:44:19

20mllu1 发表于 2022-7-18 10:02
老师您好，这是我算IRI散点图的输出文件（图片1）

根据老师您放B站的教程视频，我也是用UE删了前面三列 ...

目前版本Multiwfn根本就不需要自己改txt文件，仔细看1L

最新版Multiwfn的examples\scripts目录里直接给了IRIscatter.gnu，直接用就完了

20mllu1 发表于 Post on 2022-7-18 10:02:36

老师您好，这是我算IRI散点图的输出文件（图片1）

根据老师您放B站的教程视频，我也是用UE删了前面三列（图片2）

但是画出的图是这样子的（图片3），横坐标是从-0.05到0.05，而Multiwfn直接绘图是这样的（图4），横坐标从-0.4到0.1.

然后我用记事本改了RDGscatter.gnu中x轴范围图（5），画出的散点图依旧没有任何变化。

请问这种情况该如何解决呢？

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sobereva 发表于 Post on 2022-6-30 00:48:43

Manyu 发表于 2022-6-29 11:38
请问为何我下载了ghostscript，还是无法用irfanview打开RDGmap.ps

ghostscript没恰当安装，或者没被irfanview识别，或者你的ps文件本身就有毛病

Manyu 发表于 Post on 2022-6-29 11:38:35

请问为何我下载了ghostscript，还是无法用irfanview打开RDGmap.ps

不可理喻 发表于 Post on 2021-5-7 13:49:34

sobereva 发表于 2021-5-7 02:58
photoshop的事
用acrobat或者irfanview+ghostscript都能正常看到字符

问题已解决，谢谢老师！

sobereva 发表于 Post on 2021-5-7 02:58:19

不可理喻发表于 2021-5-6 08:47
电脑系统是win10的，Multiwfn用的是3.7版本，gnuplot用的是5.4.1版本，图是我用PS2020打开ps文件后导出的 ...

photoshop的事
用acrobat或者irfanview+ghostscript都能正常看到字符

不可理喻 发表于 Post on 2021-5-6 08:47:05

本帖最后由不可理喻于 2021-5-6 08:48 编辑

sobereva 发表于 2021-5-6 02:10
截图，并且说清楚用的是Multiwfn哪个版本，什么系统的

电脑系统是win10的，Multiwfn用的是3.7版本，gnuplot用的是5.4.1版本，图是我用PS2020打开ps文件后导出的图片

D:\gnuplot\gnuplot\bin\RDGscatter.png

sobereva 发表于 Post on 2021-5-6 02:10:22

不可理喻发表于 2021-5-5 21:33
老师你好，我想请问一下为什么我做出的散点图的横坐标是sign(l_2)r (a.u.)，而不是跟视频里一样是sign(λ_2 ...

截图，并且说清楚用的是Multiwfn哪个版本，什么系统的

不可理喻 发表于 Post on 2021-5-5 21:33:47

本帖最后由不可理喻于 2021-5-5 21:38 编辑

老师你好，我想请问一下为什么我做出的散点图的横坐标是sign(l_2)r (a.u.)，而不是跟视频里一样是sign(λ_2)ρ (a.u.)

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