lao7 发表于 2017-12-23 22:52 可以参看此帖里提到的博文中的例子 http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2100 这里也有很多例子 幻灯片：Multiwfn与波函数分析简介 http://sobereva.com/239 对于填色图通过颜色识别即可 |
sobereva 发表于 2017-12-23 21:46 请问SOB，共价键区域、孤对电子区域、原子内核以及壳层区域，这3类如何从ELF图上准确识别呢？仅凭借颜色吗？ |
lao7 发表于 2017-12-23 19:16 ELF大的区域主要包括共价键区域、孤对电子区域、原子内核以及壳层区域。C-O之间桔黄色明显，所以肯定形成了共价键 两个分子之间的弱相互作用，诸如pi-pi堆积、一般强度的氢键什么的，不会显示成共价键。你的描述，要么是体系没经过优化，结构不合理；要么是二者之间真的有什么共价作用。 |
本帖最后由 lao7 于 2017-12-23 19:18 编辑 sobereva 发表于 2017-12-23 02:34 谢谢SOB的指导和回复！看了您的回复备受启发，由此我不由想问，你怎么仅仅从我这个普通的ELF图，看出C-O之间形成的是共价键呢？基于分子间距离吗？ 我觉得很奇怪，我用两个分子相互作用（DNA磷酸基、芘），为什么相互作用力那么强，居然结果显示形成共价键。ps。结果显示，两分子距离确实很近。 |
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你在1L贴的图是普通的ELF图，ELF值域范围是[0,1]，图像表明C-O之间形成了明显的共价键，因而成键区域出现了高电子定域性区域。 1.jpg不是普通的ELF图，而是实际体系的ELF与片段组合波函数的ELF的差，这体现出CO和BH3两个片段从完全没有相互作用（只是简单地把单独计算的波函数交叠在一起）的状态变成实际波函数的过程中，ELF是怎么变化的。图中体现了两个片段从不成键状态变化成实际状态后，片段间电子定域化函数数值明显增大，体现了共价键的出现。这种图一般用不着作。由于这图体现的是差值，所以有正有负。 |
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ELF的变化和电子密度增减的变化完全是两回事，物理本质截然不同，千万不要混淆。电子密度大的地方不见得ELF大，电子密度小的地方也不见得ELF小。 考察电子密度增减，要对电子密度来作差。看 使用Multiwfn作电子密度差图 http://sobereva.com/113 |
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