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范德瓦尔斯团簇Ne_dimer的基态势能曲线

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发布时间: 2018-1-5 17:51

正文摘要:

请大家帮我看看这是怎么了 sob老师提供的最新文献关于Nedimer的,加入色散矫正-D3,遗憾的是我没有E以上的版本,所以暂时弄不了。 但是不至于连最小值都还原不出来吧,且我用这个方法和基组优化的结构是没问题 ...

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zhangpengju 发表于 Post on 2018-1-8 09:18:11
agent99 发表于 2018-1-6 02:38
这种体系的能量极小点应该很浅,你把曲线在极小点附近放大试试。
另外,B3LYP不加色散校正的话对这种很弱 ...

谢谢啦,我试试
zhangpengju 发表于 Post on 2018-1-8 09:17:35
sobereva 发表于 2018-1-6 06:49
B3LYP对这种体系根本没有极小点,即便你说的优化结果发现和实验差不多,那也只是数值巧合,因为受力已经非 ...

谢谢sob老师,我研究一下。
sobereva 发表于 Post on 2018-1-6 06:49:20
B3LYP对这种体系根本没有极小点,即便你说的优化结果发现和实验差不多,那也只是数值巧合,因为受力已经非常小了就当成优化收敛了,而不是因为B3LYP下极小点就在那里

算这个体系要拿来发表起码CCSD(T)

就算用DFT,D3校正在你的版本里不支持,起码也得用诸如wB97XD、M06-2X这样能描述色散作用的

算弱相互作用基本常识知识看
乱谈DFT-D
http://sobereva.com/83

这篇文章专门是理论研究稀有气体二聚体的,你一定要看看:DOI 10.1002/qua.25358
agent99 发表于 Post on 2018-1-6 02:38:04
这种体系的能量极小点应该很浅,你把曲线在极小点附近放大试试。
另外,B3LYP不加色散校正的话对这种很弱的范德华作用很可能无法描述。高斯版本旧没有色散校正的话,M06-2X总有吧?那个至少对弱相互作用描述好一些。
zhangpengju 发表于 Post on 2018-1-6 00:49:35
yflchx 发表于 2018-1-5 23:25
像这种色散主导的体系,B3LYP无能为力。

看曲线这么平坦,优化出个结果也算正常。

你好,能给点建议,算一下么,我看文献上加入了矫正,貌似还不错
yflchx 发表于 Post on 2018-1-5 23:25:02
本帖最后由 yflchx 于 2018-1-5 23:28 编辑

像这种色散主导的体系,B3LYP无能为力。

看曲线这么平坦,优化出个结果也算正常。

也许有人试图重新优化B3LYP的参数来做非共价相互作用(原理上是说不通的),问题会有两个:
1. 适合氢键体系的系数肯定不适合色散主导的相互作用体系。
2. 针对色散主导的体系优化参数,最终的平均误差大概会在0.5-0.7 kcal/mol左右,然后再也下不去了。

如果做类似的事,写文章投稿会遇到很大的阻力。即便是发出来也很可能被comment。
liyuanhe211 发表于 Post on 2018-1-5 21:40:39
本帖最后由 liyuanhe211 于 2018-1-5 21:41 编辑

你觉得图哪儿有问题?以及不能仅凭键长差不多就说级别没问题

ggdh 发表于 Post on 2018-1-5 21:33:45
横坐标从2.9 或者3.0开始就好
纵坐标改成相对能量 单位改成KJ/mol

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