sobereva 发表于 2018-4-26 19:39
首先我并不建议用all-bonds约束，引入的人为因素不可忽略
对键进行约束，主要目的是为了消除高频振动， ...

谢谢，sob老师，理解了

虔诚的人 发表于 2018-4-26 17:36
sob老师，请问时间不长0.1fs和0.2fs是怎么选择的？为什么time steps=0.2 ps后就没必要设置all-bond了。{: ...

首先我并不建议用all-bonds约束，引入的人为因素不可忽略
对键进行约束，主要目的是为了消除高频振动，从而可以用更大的步长。0.2fs已经算是非常小了，这种情况下没有必要对键做任何约束。一般情况，<=1fs的步长都没必要做任何约束。

sobereva 发表于 2018-1-8 18:20
既然步长都0.2fs了，all-bonds约束也没必要设了。先去了试试
乍看没有明显问题，但一些细节不好说。控压的 ...

sob老师，请问时间不长0.1fs和0.2fs是怎么选择的？为什么time steps=0.2 ps后就没必要设置all-bond了。

既然步长都0.2fs了，all-bonds约束也没必要设了。先去了试试
乍看没有明显问题，但一些细节不好说。控压的设定反复再调节调节，再看看top文件有无毛病，反复试试