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在Gaussian中做限制性优化的方法

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发布时间: 2018-1-9 16:19

正文摘要:

在Gaussian中做限制性优化的方法The way to perform restricted optimization in Gaussian 文/Sobereva @北京科音   2018-Jan-9 0 前言 量化计算时一般做的几何优化叫做全优化(full optimization), ...

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Diazo 发表于 Post on 2025-10-16 15:10:35
sob老师好,我想先做限制性优化再进行全优化,请问如果我先冻结原子优化,然后再用geom=allcheck和guess=read从chk文件读取坐标信息和波函数时,请问是否会将冻结的设定一起读取?
sobereva 发表于 Post on 2025-9-9 14:54:11
zzs799 发表于 2025-9-9 14:40
请问各位老师,我有一个问题:限制性优化得出了想要过渡态所对应的虚频,但是解开限制以后怎么也找不到,限 ...

不能说明
zzs799 发表于 Post on 2025-9-9 14:40:34
请问各位老师,我有一个问题:限制性优化得出了想要过渡态所对应的虚频,但是解开限制以后怎么也找不到,限制性优化能得出这个想要的结果能说明这个过渡态一定存在吗?
lanthanum 发表于 Post on 2025-9-4 06:50:14
Dave666 发表于 2025-9-3 18:52
老师您好,请问opt=modred是opt=modredundant的简写吗?两者是完全一样的吗?


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Dave666 发表于 Post on 2025-9-3 18:52:31
老师您好,请问opt=modred是opt=modredundant的简写吗?两者是完全一样的吗?
xxtnenu 发表于 Post on 2025-4-28 11:53:18
sobereva 发表于 2025-4-28 11:14
“受超声、研磨等机械力的影响”可能必须通过CP2K等第一性原理程序描述凝聚相结构才能表现,除非能证明简 ...

收到,谢谢sob老师解答
sobereva 发表于 Post on 2025-4-28 11:14:08
xxtnenu 发表于 2025-4-28 01:08
看到有用AIMD做分子动力学近似外力对分子的作用来研究力和机械形变对分子反应性的影响,也有使用Gaussian ...

“受超声、研磨等机械力的影响”可能必须通过CP2K等第一性原理程序描述凝聚相结构才能表现,除非能证明简单的单分子或几分子模型就足矣表现这种效应,若有像样的文献里用Gaussian/ORCA做过类似研究可以效仿。
xxtnenu 发表于 Post on 2025-4-28 01:08:25
sobereva 发表于 2025-4-26 18:54
我不知道“机械力过程用Gaussian”你具体想怎么做
你说的这些问题没有具体前提、目的,没法回答

看到有用AIMD做分子动力学近似外力对分子的作用来研究力和机械形变对分子反应性的影响,也有使用Gaussian基于CoGEF(constrained geometries simulate external force)的方法,通过约束几何优化模拟分子形变的影响,还有使用orca直接给分子施加外力。目的是想研究分子受超声、研磨等机械力的影响,所以想确定一个合适的理论计算软件模拟该过程。
sobereva 发表于 Post on 2025-4-26 18:54:05
xxtnenu 发表于 2025-4-26 17:36
谢谢sob老师回复,还想请问sob老师,与orca可以直接施加外力相比,描述机械力过程用Gaussian和orca都可以 ...

我不知道“机械力过程用Gaussian”你具体想怎么做
你说的这些问题没有具体前提、目的,没法回答
xxtnenu 发表于 Post on 2025-4-26 17:36:44

谢谢sob老师回复,还想请问sob老师,与orca可以直接施加外力相比,描述机械力过程用Gaussian和orca都可以吗?还是如果想严谨一些应该用orca呢?如果用orca直接施加外力,对比前后构象的波函数讨论即可还是应该进行AIMD计算呢?谢谢sob老师
sobereva 发表于 Post on 2025-4-23 11:48:38
xxtnenu 发表于 2025-4-22 13:05
请问sob老师,冻结原子进行优化的方法能否用于模拟机械力对化合物的影响吗?即在约束条件下执行几何优化 ...

可以
xxtnenu 发表于 Post on 2025-4-22 13:05:43
sobereva 发表于 2021-9-5 12:41
这种显然不合理的行为不会有文献专门说

请问sob老师,冻结原子进行优化的方法能否用于模拟机械力对化合物的影响吗?即在约束条件下执行几何优化计算,在分子形变过程中,扫描势能面,在力作用下计算势能面每个点的构象,而后计算每个构象的波函数进行讨论?
sobereva 发表于 Post on 2024-12-25 18:19:15
xingchangrui 发表于 2024-12-25 16:06
请问社长,如果只优化分子结构中的特定的几个键长,请问如何设置呢?

把其它的内坐标都冻结
xingchangrui 发表于 Post on 2024-12-25 16:06:39
请问社长,如果只优化分子结构中的特定的几个键长,请问如何设置呢?

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