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对称的分子,自己计算的homo的分布和文章的对应不起来

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发布时间: 2015-4-5 21:35

正文摘要:

为了计算实验上的分子,是一种D-A-D类型的,两边是相同的。之前的帖子http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=894&extra= 我咨询过,但是没有解决。 我在表述一下我的意思。 我计算实验的分子, ...

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ZiggyZhang 发表于 Post on 2026-1-13 00:50:45
2026年,感谢老哥提供的思路,我最近几天在做一个A-苯环-A结构的药剂,两个活性基团,计算出来的HOMO也只在一个基团上,另外一个是HOMO-1。困扰我好几天了。我用的是material studio软件,前几次失败都是分子结构不对称,Find symmetry检索出来都是C1,压根没有任何对称性。后来建了一个Cs对称的构象。跑了一下,HOMO是分布在两个基团上的。感谢前辈老哥们提供的思路!
cccxq 发表于 Post on 2024-9-29 10:25:45
老师,我想问问我用MS 算出来HOMO和LUMO中Cl原子没有贡献,但是DOS中Cl原子贡献很高,这种情况正常吗
jlx_ 发表于 Post on 2015-4-27 12:14:16
小范范1989 发表于 2015-4-27 11:40
1:homo是最高占据轨道,分子轨道理论。
2:donor是我们所说的基团,比如所供电子基团就叫做donor,吸电 ...

对了,还要问一下您,HOMO-LUMO一般是负值还是正数?我看了一篇文章(Experimental and density functional studies on the corrosion behavior of the copper-nickel-tin alloy),他的结果是正数,但是我按照他的参数算出来的全是负数...
jlx_ 发表于 Post on 2015-4-27 11:48:13
小范范1989 发表于 2015-4-27 11:40
1:homo是最高占据轨道,分子轨道理论。
2:donor是我们所说的基团,比如所供电子基团就叫做donor,吸电 ...

恩恩,明白了,就是说看这个图的时候,谁上面的面积大,谁的电荷就多,容易给电子。但是不是很明白的是这个HOMO donor和Fukui(+)怎么扯上关系了?Fukui图和HOMO分布图一样?

QQ截图20150427114728.bmp (804.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 88)

QQ截图20150427114728.bmp
小范范1989 发表于 Post on 2015-4-27 11:40:20
jlx_ 发表于 2015-4-27 11:31
弱弱的问下楼主,HOMO的donor是什么?有什么用?

1:homo是最高占据轨道,分子轨道理论。
2:donor是我们所说的基团,比如所供电子基团就叫做donor,吸电子基团就叫acceptor。当然这个吸电子和供电子基团不是固定不变的,要分情况看。
3:两个的联系,分子在激发的时候,如果是CT态这样的分子,一般都是电子从donor转移到acceptor上。hom一般分布在donor。lumo一般分布在acceptor上
4:我理解的不是很多,错误之处还请指正
jlx_ 发表于 Post on 2015-4-27 11:31:55
弱弱的问下楼主,HOMO的donor是什么?有什么用?
小范范1989 发表于 Post on 2015-4-25 08:17:22
卡开发发 发表于 2015-4-24 21:56
已在Gaussview重新指定为Cs的点群了。
已测试,HOMO对称。

谢谢你,还麻烦你都测试了,谢谢你的关注,更谢谢你的帮助。祝好。
卡开发发 发表于 Post on 2015-4-24 21:56:19
本帖最后由 卡开发发 于 2015-4-24 23:04 编辑
小范范1989 发表于 2015-4-13 22:15
谢谢您,让您费心了,

已在Gaussview重新指定为Cs的点群了。
已测试,HOMO对称。

DMAC-DPS.gjf

6.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 25

小范范1989 发表于 Post on 2015-4-13 22:15:29
卡开发发 发表于 2015-4-13 22:14
这样我就很难说得清什么原因了,以往这样的问题我都是自己check过再给出结果的,最近忙了点,等有时间我 ...

谢谢您,让您费心了,
卡开发发 发表于 Post on 2015-4-13 22:14:26
小范范1989 发表于 2015-4-13 20:12
卡开发发,你好,当时您给的分子,我计算了,算出来的homo还是在一个D上。可能是由于分子对称性的问题没 ...

这样我就很难说得清什么原因了,以往这样的问题我都是自己check过再给出结果的,最近忙了点,等有时间我也亲自做计算测试一下试试。
小范范1989 发表于 Post on 2015-4-13 20:12:53
卡开发发 发表于 2015-4-7 00:42
试试看这个gjf,如果还不行我就没啥办法了。

卡开发发,你好,当时您给的分子,我计算了,算出来的homo还是在一个D上。可能是由于分子对称性的问题没弄好。这次来参加sob的培训班了,所以回复的您比较晚,不好意思。我问了问sob,我想在使用gview按照对称性来重新画分子。等我明天培训结束,后天回学校,我再计算一下。麻烦您了。谢谢您
小范范1989 发表于 Post on 2015-4-7 10:20:52
卡开发发 发表于 2015-4-7 00:42
试试看这个gjf,如果还不行我就没啥办法了。

谢谢您,给您添麻烦了。我先算算试试,等成功的话,我再通知您。谢谢。
卡开发发 发表于 Post on 2015-4-7 00:42:50
小范范1989 发表于 2015-4-6 22:48
谢谢您,我刚刚回宿舍才看到,麻烦您了。

试试看这个gjf,如果还不行我就没啥办法了。

DMAC-DPS.gjf

6.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 19

小范范1989 发表于 Post on 2015-4-6 22:48:04
卡开发发 发表于 2015-4-6 22:43
1、指的是不通过Ab initio或DFT而是通过Force filed如amber或uff;
2、materials studio同样提供了力场 ...

谢谢您,我刚刚回宿舍才看到,麻烦您了。

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