计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

VMD如何把氢原子隐去

查看数: 21170 | 评论数: 14 | 收藏 Add to favorites 8
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2018-3-12 16:52

正文摘要:

在VMD中如和让氢原子不显示?? vmd中如何更改键的颜色??

回复 Reply

mzb1987 发表于 Post on 2022-1-10 11:12:19
sobereva 发表于 2022-1-6 21:51
恰当用选择语句
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504(http://bbs.keinsci.com/thr ...

谢谢社长
darkseal 发表于 Post on 2022-1-7 19:17:40
representation 里面,selected atom 中输入:not element H
sobereva 发表于 Post on 2022-1-6 21:51:36
mzb1987 发表于 2022-1-6 15:55
请问如何隐去部分氢原子,只保留与过渡金属相连的氢原子

恰当用选择语句
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html
mzb1987 发表于 Post on 2022-1-6 15:55:37
sobereva 发表于 2020-10-4 15:01
没有。只能在选择语句里用not ...取消选中

请问如何隐去部分氢原子,只保留与过渡金属相连的氢原子
sobereva 发表于 Post on 2020-10-4 15:01:53
虎王 发表于 2020-10-4 14:22
那如果要隐藏其它元素,是否也有相应指令?

没有。只能在选择语句里用not ...取消选中
虎王 发表于 Post on 2020-10-4 14:22:36
sobereva 发表于 2018-3-12 21:16
PS:not hydrogen更简单写法是noh

那如果要隐藏其它元素,是否也有相应指令?
material 发表于 Post on 2018-8-10 10:36:01
978142355 发表于 2018-3-12 20:14
1.载入分子后,在graphics->representation中,selected atom中输入not hydrogen,如此不显示H原子,如图1 ...

感谢您的帮助,学到了!
lonemen 发表于 Post on 2018-5-31 09:43:08
哇,sob老师的命令好简洁!
涅涅尘 发表于 Post on 2018-3-14 09:31:52
978142355 发表于 2018-3-13 21:30
Bonds的style中,Bond Radius你设置为0了,所以没显示出来。

非常感谢 收获良多
978142355 发表于 Post on 2018-3-13 21:30:42
涅涅尘 发表于 2018-3-13 19:16
感谢回复 很有帮助
我用noh把氢原子隐去了
但是该键的颜色没有成功 我也是照你说的在“drawing metho ...

Bonds的style中,Bond Radius你设置为0了,所以没显示出来。
978142355 发表于 Post on 2018-3-12 21:21:41
sobereva 发表于 2018-3-12 21:16
PS:not hydrogen更简单写法是noh

谢谢sob老师指出更简单方法,学习了~
sobereva 发表于 Post on 2018-3-12 21:16:42
PS:not hydrogen更简单写法是noh
978142355 发表于 Post on 2018-3-12 20:14:08
1.载入分子后,在graphics->representation中,selected atom中输入not hydrogen,如此不显示H原子,如图1所示;

2.我一般的做法是这样的,仅供参考:
建立两层,一层用某个风格显示,如本图中的CPK风格;另一层是Bonds风格,在coloring method中,选择一个颜色,比如白色。如图2所示。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
让你变成回忆 + 3 谢谢分享

查看全部评分 View all ratings

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 07:25 , Processed in 0.198504 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list